James Moger
2012-03-27 f5432e015d173f2665f7ca34735057e7b2b25d16
src/com/gitblit/LuceneExecutor.java
@@ -25,7 +25,6 @@
import java.text.MessageFormat;
import java.text.ParseException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.Collections;
import java.util.Comparator;
import java.util.HashMap;
@@ -74,6 +73,7 @@
import org.eclipse.jgit.lib.ObjectLoader;
import org.eclipse.jgit.lib.ObjectReader;
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache.FileKey;
import org.eclipse.jgit.revwalk.RevCommit;
import org.eclipse.jgit.revwalk.RevTree;
import org.eclipse.jgit.revwalk.RevWalk;
@@ -89,6 +89,7 @@
import com.gitblit.models.IssueModel.Attachment;
import com.gitblit.models.PathModel.PathChangeModel;
import com.gitblit.models.RefModel;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.IssueUtils;
@@ -137,51 +138,42 @@
   private final Map<String, IndexSearcher> searchers = new ConcurrentHashMap<String, IndexSearcher>();
   private final Map<String, IndexWriter> writers = new ConcurrentHashMap<String, IndexWriter>();
   
   private final Set<String> excludedExtensions = new TreeSet<String>(Arrays.asList("7z", "arc",
         "arj", "bin", "bmp", "dll", "doc", "docx", "exe", "gif", "gz", "jar", "jpg", "lib",
         "lzh", "odg", "pdf", "ppt", "png", "so", "swf", "xcf", "xls", "xlsx", "zip"));
   private final Set<String> excludedBranches = new TreeSet<String>(
         Arrays.asList("/refs/heads/gb-issues"));
   private final String luceneIgnoreExtensions = "7z arc arj bin bmp dll doc docx exe gif gz jar jpg lib lzh odg odf odt pdf ppt png so swf xcf xls xlsx zip";
   private Set<String> excludedExtensions;
   
   public LuceneExecutor(IStoredSettings settings, File repositoriesFolder) {
      this.storedSettings = settings;
      this.repositoriesFolder = repositoriesFolder;
      String exts = luceneIgnoreExtensions;
      if (settings != null) {
         exts = settings.getString(Keys.web.luceneIgnoreExtensions, exts);
      }
      excludedExtensions = new TreeSet<String>(StringUtils.getStringsFromValue(exts));
   }
   /**
    * Indicates if the Lucene executor can index repositories.
    *
    * @return true if the Lucene executor is ready to index repositories
    */
   public boolean isReady() {
      return storedSettings.getBoolean(Keys.lucene.enable, false);
   }
   /**
    * Run is executed by the gitblit executor service at whatever frequency
    * is specified in the settings.  Because this is called by an executor
    * service, calls will queue - i.e. there can never be concurrent execution
    * of repository index updates.
    * Run is executed by the Gitblit executor service.  Because this is called
    * by an executor service, calls will queue - i.e. there can never be
    * concurrent execution of repository index updates.
    */
   @Override
   public void run() {
      if (!isReady()) {
      if (!storedSettings.getBoolean(Keys.web.allowLuceneIndexing, true)) {
         // Lucene indexing is disabled
         return;
      }
      // reload the excluded extensions
      String exts = storedSettings.getString(Keys.web.luceneIgnoreExtensions, luceneIgnoreExtensions);
      excludedExtensions = new TreeSet<String>(StringUtils.getStringsFromValue(exts));
      for (String repositoryName : GitBlit.self().getRepositoryList()) {
         Repository repository = GitBlit.self().getRepository(repositoryName);
         if (repository == null) {
            logger.warn(MessageFormat.format(
                  "Lucene executor could not find repository {0}. Skipping.",
                  repositoryName));
            continue;
      for (String repositoryName: GitBlit.self().getRepositoryList()) {
         RepositoryModel model = GitBlit.self().getRepositoryModel(repositoryName);
         if (model.hasCommits && !ArrayUtils.isEmpty(model.indexedBranches)) {
            Repository repository = GitBlit.self().getRepository(model.name);
            index(model, repository);
            repository.close();
            System.gc();
         }
         // TODO allow repository to bypass Lucene indexing
         index(repositoryName, repository);
         repository.close();
         System.gc();
      }
   }
@@ -194,43 +186,38 @@
    * @param repository
    *            the repository object
    */
   protected void index(String name, Repository repository) {
   private void index(RepositoryModel model, Repository repository) {
      try {
         if (JGitUtils.hasCommits(repository)) {
            if (shouldReindex(repository)) {
               // (re)build the entire index
               IndexResult result = reindex(name, repository);
               if (result.success) {
                  if (result.commitCount > 0) {
                     String msg = "Built {0} Lucene index from {1} commits and {2} files across {3} branches in {4} secs";
                     logger.info(MessageFormat.format(msg, name,
                           result.commitCount, result.blobCount, result.branchCount, result.duration()));
                  }
               } else {
                  String msg = "Could not build {0} Lucene index!";
                  logger.error(MessageFormat.format(msg, name));
         if (shouldReindex(repository)) {
            // (re)build the entire index
            IndexResult result = reindex(model, repository);
            if (result.success) {
               if (result.commitCount > 0) {
                  String msg = "Built {0} Lucene index from {1} commits and {2} files across {3} branches in {4} secs";
                  logger.info(MessageFormat.format(msg, model.name, result.commitCount,
                        result.blobCount, result.branchCount, result.duration()));
               }
            } else {
               // update the index with latest commits
               IndexResult result = updateIndex(name, repository);
               if (result.success) {
                  if (result.commitCount > 0) {
                     String msg = "Updated {0} Lucene index with {1} commits and {2} files across {3} branches in {4} secs";
                     logger.info(MessageFormat.format(msg, name,
                           result.commitCount, result.blobCount, result.branchCount, result.duration()));
                  }
               } else {
                  String msg = "Could not update {0} Lucene index!";
                  logger.error(MessageFormat.format(msg, name));
               }
               String msg = "Could not build {0} Lucene index!";
               logger.error(MessageFormat.format(msg, model.name));
            }
         } else {
            logger.info(MessageFormat.format("Skipped Lucene index of empty repository {0}",
                  name));
            // update the index with latest commits
            IndexResult result = updateIndex(model, repository);
            if (result.success) {
               if (result.commitCount > 0) {
                  String msg = "Updated {0} Lucene index with {1} commits and {2} files across {3} branches in {4} secs";
                  logger.info(MessageFormat.format(msg, model.name, result.commitCount,
                        result.blobCount, result.branchCount, result.duration()));
               }
            } else {
               String msg = "Could not update {0} Lucene index!";
               logger.error(MessageFormat.format(msg, model.name));
            }
         }
      } catch (Throwable t) {
         logger.error(MessageFormat.format("Lucene indexing failure for {0}", name), t);
         logger.error(MessageFormat.format("Lucene indexing failure for {0}", model.name), t);
      }
   }
   
@@ -239,7 +226,16 @@
    * 
    * @param repositoryName
    */
   public void close(String repositoryName) {
   public synchronized void close(String repositoryName) {
      try {
         IndexSearcher searcher = searchers.remove(repositoryName);
         if (searcher != null) {
            searcher.getIndexReader().close();
         }
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to close index searcher for " + repositoryName, e);
      }
      try {
         IndexWriter writer = writers.remove(repositoryName);
         if (writer != null) {
@@ -247,23 +243,14 @@
         }
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to close index writer for " + repositoryName, e);
      }
      try {
         IndexSearcher searcher = searchers.remove(repositoryName);
         if (searcher != null) {
            searcher.close();
         }
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to close index searcher for " + repositoryName, e);
      }
      }
   }
   /**
    * Close all Lucene indexers.
    * 
    */
   public void close() {
   public synchronized void close() {
      // close all writers
      for (String writer : writers.keySet()) {
         try {
@@ -277,7 +264,7 @@
      // close all searchers
      for (String searcher : searchers.keySet()) {
         try {
            searchers.get(searcher).close();
            searchers.get(searcher).getIndexReader().close();
         } catch (Throwable t) {
            logger.error("Failed to close Lucene searcher for " + searcher, t);
         }
@@ -294,18 +281,9 @@
    */
   public boolean deleteIndex(String repositoryName) {
      try {
         // remove the repository index writer from the cache and close it
         IndexWriter writer = writers.remove(repositoryName);
         if (writer != null) {
            writer.close();
            writer = null;
         }
         // remove the repository index searcher from the cache and close it
         IndexSearcher searcher = searchers.remove(repositoryName);
         if (searcher != null) {
            searcher.close();
            searcher = null;
         }
         // close any open writer/searcher
         close(repositoryName);
         // delete the index folder
         File repositoryFolder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
         File luceneIndex = new File(repositoryFolder, LUCENE_DIR);
@@ -369,7 +347,7 @@
    * @return tree
    * @throws IOException
    */
   protected RevTree getTree(final RevWalk walk, final RevCommit commit)
   private RevTree getTree(final RevWalk walk, final RevCommit commit)
         throws IOException {
      final RevTree tree = commit.getTree();
      if (tree != null) {
@@ -409,7 +387,7 @@
    * @param repository
    * @return true of the on-disk index format is different than INDEX_VERSION
    */
   protected boolean shouldReindex(Repository repository) {
   private boolean shouldReindex(Repository repository) {
      try {
         FileBasedConfig config = getConfig(repository);
         config.load();
@@ -430,15 +408,15 @@
    * @param repository
    * @return IndexResult
    */
   public IndexResult reindex(String repositoryName, Repository repository) {
      IndexResult result = new IndexResult();
      if (!deleteIndex(repositoryName)) {
   public IndexResult reindex(RepositoryModel model, Repository repository) {
      IndexResult result = new IndexResult();
      if (!deleteIndex(model.name)) {
         return result;
      }
      try {         
         FileBasedConfig config = getConfig(repository);
         Set<String> indexedCommits = new TreeSet<String>();
         IndexWriter writer = getIndexWriter(repositoryName);
         IndexWriter writer = getIndexWriter(model.name);
         // build a quick lookup of tags
         Map<String, List<String>> tags = new HashMap<String, List<String>>();
         for (RefModel tag : JGitUtils.getTags(repository, false, -1)) {
@@ -470,7 +448,7 @@
         ObjectId defaultBranchId = JGitUtils.getDefaultBranch(repository);
         for (RefModel branch :  branches) {
            if (branch.getObjectId().equals(defaultBranchId)) {
               defaultBranch = branch;
               defaultBranch = branch;
               break;
            }
         }
@@ -479,7 +457,23 @@
         
         // walk through each branch
         for (RefModel branch : branches) {
            if (excludedBranches.contains(branch.getName())) {
            boolean indexBranch = false;
            if (model.indexedBranches.contains(com.gitblit.Constants.DEFAULT_BRANCH)
                  && branch.equals(defaultBranch)) {
               // indexing "default" branch
               indexBranch = true;
            } else if (IssueUtils.GB_ISSUES.equals(branch)) {
               // skip the GB_ISSUES branch because it is indexed later
               // note: this is different than updateIndex
               indexBranch = false;
            } else {
               // normal explicit branch check
               indexBranch = model.indexedBranches.contains(branch.getName());
            }
            // if this branch is not specifically indexed then skip
            if (!indexBranch) {
               continue;
            }
@@ -562,7 +556,7 @@
                  // index the blob content
                  if (StringUtils.isEmpty(ext) || !excludedExtensions.contains(ext)) {                     
                     ObjectLoader ldr = repository.open(blobId, Constants.OBJ_BLOB);
                     InputStream in = ldr.openStream();
                     InputStream in = ldr.openStream();
                     int n;
                     while ((n = in.read(tmp)) > 0) {
                        os.write(tmp, 0, n);
@@ -624,11 +618,11 @@
         // commit all changes and reset the searcher
         config.setInt(CONF_INDEX, null, CONF_VERSION, INDEX_VERSION);
         config.save();
         resetIndexSearcher(repositoryName);
         writer.commit();
         resetIndexSearcher(model.name);
         result.success();
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Exception while reindexing " + repositoryName, e);
         logger.error("Exception while reindexing " + model.name, e);
      }
      return result;
   }
@@ -648,31 +642,13 @@
         String branch, RevCommit commit) {
      IndexResult result = new IndexResult();
      try {
         if (excludedBranches.contains(branch)) {
            if (IssueUtils.GB_ISSUES.equals(branch)) {
               // index an issue
               String issueId = commit.getShortMessage().substring(2).trim();
               IssueModel issue = IssueUtils.getIssue(repository, issueId);
               if (issue == null) {
                  // issue was deleted, remove from index
                  deleteIssue(repositoryName, issueId);
                  result.success = true;
                  return result;
               }
               result.success = index(repositoryName, issue);
               result.issueCount++;
               return result;
            }
            return result;
         }
         List<PathChangeModel> changedPaths = JGitUtils.getFilesInCommit(repository, commit);
         String revDate = DateTools.timeToString(commit.getCommitTime() * 1000L,
               Resolution.MINUTE);
         IndexWriter writer = getIndexWriter(repositoryName);
         for (PathChangeModel path : changedPaths) {
            // delete the indexed blob
            deleteBlob(repositoryName, branch, path.path);
            deleteBlob(repositoryName, branch, path.name);
            // re-index the blob
            if (!ChangeType.DELETE.equals(path.changeType)) {
@@ -705,8 +681,18 @@
            }
         }
         writer.commit();
         Document doc = createDocument(commit, null);
         // get any annotated commit tags
         List<String> commitTags = new ArrayList<String>();
         for (RefModel ref : JGitUtils.getTags(repository, false, -1)) {
            if (ref.isAnnotatedTag() && ref.getReferencedObjectId().equals(commit.getId())) {
               commitTags.add(ref.displayName);
            }
         }
         // create and write the Lucene document
         Document doc = createDocument(commit, commitTags);
         doc.add(new Field(FIELD_BRANCH, branch, Store.YES, Index.ANALYZED));
         result.commitCount++;
         result.success = index(repositoryName, doc);
      } catch (Exception e) {
@@ -779,11 +765,11 @@
   /**
    * Updates a repository index incrementally from the last indexed commits.
    * 
    * @param repositoryName
    * @param model
    * @param repository
    * @return IndexResult
    */
   protected IndexResult updateIndex(String repositoryName, Repository repository) {
   private IndexResult updateIndex(RepositoryModel model, Repository repository) {
      IndexResult result = new IndexResult();
      try {
         FileBasedConfig config = getConfig(repository);
@@ -811,14 +797,55 @@
            deletedBranches.add(branch);
         }
         // walk through each branches
         // get the local branches
         List<RefModel> branches = JGitUtils.getLocalBranches(repository, true, -1);
         // sort them by most recently updated
         Collections.sort(branches, new Comparator<RefModel>() {
            @Override
            public int compare(RefModel ref1, RefModel ref2) {
               return ref2.getDate().compareTo(ref1.getDate());
            }
         });
         // reorder default branch to first position
         RefModel defaultBranch = null;
         ObjectId defaultBranchId = JGitUtils.getDefaultBranch(repository);
         for (RefModel branch :  branches) {
            if (branch.getObjectId().equals(defaultBranchId)) {
               defaultBranch = branch;
               break;
            }
         }
         branches.remove(defaultBranch);
         branches.add(0, defaultBranch);
         // walk through each branches
         for (RefModel branch : branches) {
            String branchName = branch.getName();
            boolean indexBranch = false;
            if (model.indexedBranches.contains(com.gitblit.Constants.DEFAULT_BRANCH)
                  && branch.equals(defaultBranch)) {
               // indexing "default" branch
               indexBranch = true;
            } else if (IssueUtils.GB_ISSUES.equals(branch)) {
               // update issues modified on the GB_ISSUES branch
               // note: this is different than reindex
               indexBranch = true;
            } else {
               // normal explicit branch check
               indexBranch = model.indexedBranches.contains(branch.getName());
            }
            // if this branch is not specifically indexed then skip
            if (!indexBranch) {
               continue;
            }
            // remove this branch from the deletedBranches set
            deletedBranches.remove(branchName);
            // determine last commit
            String keyName = getBranchKey(branchName);
            String lastCommit = config.getString(CONF_BRANCH, null, keyName);
@@ -836,10 +863,33 @@
               result.branchCount += 1;
            }
            
            // track the issue ids that we have already indexed
            Set<String> indexedIssues = new TreeSet<String>();
            // reverse the list of commits so we start with the first commit            
            Collections.reverse(revs);
            for (RevCommit commit : revs) {
               result.add(index(repositoryName, repository, branchName, commit));
            for (RevCommit commit : revs) {
               if (IssueUtils.GB_ISSUES.equals(branch)) {
                  // only index an issue once during updateIndex
                  String issueId = commit.getShortMessage().substring(2).trim();
                  if (indexedIssues.contains(issueId)) {
                     continue;
                  }
                  indexedIssues.add(issueId);
                  IssueModel issue = IssueUtils.getIssue(repository, issueId);
                  if (issue == null) {
                     // issue was deleted, remove from index
                     deleteIssue(model.name, issueId);
                  } else {
                     // issue was updated
                     index(model.name, issue);
                     result.issueCount++;
                  }
               } else {
                  // index a commit
                  result.add(index(model.name, repository, branchName, commit));
               }
            }
            // update the config
@@ -853,14 +903,14 @@
         // unless a branch really was deleted and no longer exists
         if (deletedBranches.size() > 0) {
            for (String branch : deletedBranches) {
               IndexWriter writer = getIndexWriter(repositoryName);
               IndexWriter writer = getIndexWriter(model.name);
               writer.deleteDocuments(new Term(FIELD_BRANCH, branch));
               writer.commit();
            }
         }
         result.success = true;
      } catch (Throwable t) {
         logger.error(MessageFormat.format("Exception while updating {0} Lucene index", repositoryName), t);
         logger.error(MessageFormat.format("Exception while updating {0} Lucene index", model.name), t);
      }
      return result;
   }
@@ -928,8 +978,8 @@
      try {         
         IndexWriter writer = getIndexWriter(repositoryName);
         writer.addDocument(doc);
         resetIndexSearcher(repositoryName);
         writer.commit();
         resetIndexSearcher(repositoryName);
         return true;
      } catch (Exception e) {
         logger.error(MessageFormat.format("Exception while incrementally updating {0} Lucene index", repositoryName), e);
@@ -937,8 +987,10 @@
      return false;
   }
   private SearchResult createSearchResult(Document doc, float score) throws ParseException {
   private SearchResult createSearchResult(Document doc, float score, int hitId, int totalHits) throws ParseException {
      SearchResult result = new SearchResult();
      result.hitId = hitId;
      result.totalHits = totalHits;
      result.score = score;
      result.date = DateTools.stringToDate(doc.get(FIELD_DATE));
      result.summary = doc.get(FIELD_SUMMARY);      
@@ -961,7 +1013,7 @@
   private synchronized void resetIndexSearcher(String repository) throws IOException {
      IndexSearcher searcher = searchers.remove(repository);
      if (searcher != null) {
         searcher.close();
         searcher.getIndexReader().close();
      }
   }
@@ -991,8 +1043,8 @@
    * @throws IOException
    */
   private IndexWriter getIndexWriter(String repository) throws IOException {
      IndexWriter indexWriter = writers.get(repository);
      File repositoryFolder = new File(repositoriesFolder, repository);
      IndexWriter indexWriter = writers.get(repository);
      File repositoryFolder = FileKey.resolve(new File(repositoriesFolder, repository), FS.DETECTED);
      File indexFolder = new File(repositoryFolder, LUCENE_DIR);
      Directory directory = FSDirectory.open(indexFolder);      
@@ -1014,19 +1066,21 @@
    * 
    * @param text
    *            if the text is null or empty, null is returned
    * @param maximumHits
    *            the maximum number of hits to collect
    * @param page
    *            the page number to retrieve. page is 1-indexed.
    * @param pageSize
    *            the number of elements to return for this page
    * @param repositories
    *            a list of repositories to search. if no repositories are
    *            specified null is returned.
    * @return a list of SearchResults in order from highest to the lowest score
    * 
    */
   public List<SearchResult> search(String text, int maximumHits, List<String> repositories) {
   public List<SearchResult> search(String text, int page, int pageSize, List<String> repositories) {
      if (ArrayUtils.isEmpty(repositories)) {
         return null;
      }
      return search(text, maximumHits, repositories.toArray(new String[0]));
      return search(text, page, pageSize, repositories.toArray(new String[0]));
   }
   
   /**
@@ -1034,15 +1088,17 @@
    * 
    * @param text
    *            if the text is null or empty, null is returned
    * @param maximumHits
    *            the maximum number of hits to collect
    * @param page
    *            the page number to retrieve. page is 1-indexed.
    * @param pageSize
    *            the number of elements to return for this page
    * @param repositories
    *            a list of repositories to search. if no repositories are
    *            specified null is returned.
    * @return a list of SearchResults in order from highest to the lowest score
    * 
    */
   public List<SearchResult> search(String text, int maximumHits, String... repositories) {
    */
   public List<SearchResult> search(String text, int page, int pageSize, String... repositories) {
      if (StringUtils.isEmpty(text)) {
         return null;
      }
@@ -1079,14 +1135,15 @@
            searcher = new IndexSearcher(reader);
         }
         Query rewrittenQuery = searcher.rewrite(query);
         TopScoreDocCollector collector = TopScoreDocCollector.create(maximumHits, true);
         TopScoreDocCollector collector = TopScoreDocCollector.create(5000, true);
         searcher.search(rewrittenQuery, collector);
         ScoreDoc[] hits = collector.topDocs().scoreDocs;
         int offset = Math.max(0, (page - 1) * pageSize);
         ScoreDoc[] hits = collector.topDocs(offset, pageSize).scoreDocs;
         int totalHits = collector.getTotalHits();
         for (int i = 0; i < hits.length; i++) {
            int docId = hits[i].doc;
            Document doc = searcher.doc(docId);
            // TODO identify the source index for the doc, then eliminate FIELD_REPOSITORY
            SearchResult result = createSearchResult(doc, hits[i].score);
            SearchResult result = createSearchResult(doc, hits[i].score, offset + i + 1, totalHits);
            if (repositories.length == 1) {
               // single repository search
               result.repository = repositories[0];
@@ -1118,42 +1175,82 @@
    */
   private String getHighlightedFragment(Analyzer analyzer, Query query,
         String content, SearchResult result) throws IOException, InvalidTokenOffsetsException {
      content = content == null ? "":StringUtils.escapeForHtml(content, false);
      if (content == null) {
         content = "";
      }
      int fragmentLength = SearchObjectType.commit == result.type ? 512 : 150;
      QueryScorer scorer = new QueryScorer(query, "content");
      Fragmenter fragmenter;
      // TODO improve the fragmenter - hopefully on line breaks
      if (SearchObjectType.commit == result.type) {
         fragmenter = new SimpleSpanFragmenter(scorer, 1024);
      } else {
         fragmenter = new SimpleSpanFragmenter(scorer, 150);
      }
      Fragmenter fragmenter = new SimpleSpanFragmenter(scorer, fragmentLength);
      // use an artificial delimiter for the token
      String termTag = "<!--[";
      String termTagEnd = "]-->";
      String termTag = "!!--[";
      String termTagEnd = "]--!!";
      SimpleHTMLFormatter formatter = new SimpleHTMLFormatter(termTag, termTagEnd);
      Highlighter highlighter = new Highlighter(formatter, scorer);      
      highlighter.setTextFragmenter(fragmenter);
      String [] fragments = highlighter.getBestFragments(analyzer, "content", content, 5);
      String [] fragments = highlighter.getBestFragments(analyzer, "content", content, 3);
      if (ArrayUtils.isEmpty(fragments)) {
         if (SearchObjectType.blob  == result.type) {
            return "";
         }
         return "<pre class=\"text\">" + content + "</pre>";
         // clip commit message
         String fragment = content;
         if (fragment.length() > fragmentLength) {
            fragment = fragment.substring(0, fragmentLength) + "...";
         }
         return "<pre class=\"text\">" + StringUtils.escapeForHtml(fragment, true) + "</pre>";
      }
      int contentPos = 0;
      StringBuilder sb = new StringBuilder();
      for (int i = 0, len = fragments.length; i < len; i++) {
         String fragment = fragments[i];
         String tag = "<pre class=\"text\">";
         // resurrect the raw fragment from removing the artificial delimiters
         String raw = fragment.replace(termTag, "").replace(termTagEnd, "");
         sb.append(getPreTag(result, raw, content));
         String raw = fragment.replace(termTag, "").replace(termTagEnd, "");
         // determine position of the raw fragment in the content
         int pos = content.indexOf(raw, contentPos);
         // restore complete first line of fragment
         int c = pos;
         while (c > 0) {
            c--;
            if (content.charAt(c) == '\n') {
               break;
            }
         }
         if (c > 0) {
            // inject leading chunk of first fragment line
            fragment = content.substring(c + 1, pos) + fragment;
         }
         if (SearchObjectType.blob  == result.type) {
            // count lines as offset into the content for this fragment
            int line = Math.max(1, StringUtils.countLines(content.substring(0, pos)));
            // create fragment tag with line number and language
            String lang = "";
            String ext = StringUtils.getFileExtension(result.path).toLowerCase();
            if (!StringUtils.isEmpty(ext)) {
               // maintain leading space!
               lang = " lang-" + ext;
            }
            tag = MessageFormat.format("<pre class=\"prettyprint linenums:{0,number,0}{1}\">", line, lang);
            // update offset into content
            contentPos = pos + raw.length() + 1;
         }
         
         sb.append(tag);
         // replace the artificial delimiter with html tags
         String html = fragment.replace(termTag, "<span class=\"highlight\">").replace(termTagEnd, "</span>");
         String html = StringUtils.escapeForHtml(fragment, false);
         html = html.replace(termTag, "<span class=\"highlight\">").replace(termTagEnd, "</span>");
         sb.append(html);
         sb.append("</pre>");
         if (i < len - 1) {
@@ -1161,31 +1258,7 @@
         }
      }
      return sb.toString();
   }
   /**
    * Returns the appropriate tag for a fragment. Commit messages are visually
    * differentiated from blob fragments.
    *
    * @param result
    * @param fragment
    * @param content
    * @return an html tag appropriate for the fragment
    */
   private String getPreTag(SearchResult result, String fragment, String content) {
      String pre = "<pre class=\"text\">";
      if (SearchObjectType.blob  == result.type) {
         int line = StringUtils.countLines(content.substring(0, content.indexOf(fragment)));
         int lastDot = result.path.lastIndexOf('.');
         if (lastDot > -1) {
            String ext = result.path.substring(lastDot + 1).toLowerCase();
            pre = MessageFormat.format("<pre class=\"prettyprint linenums:{0,number,0} lang-{1}\">", line, ext);
         } else {
            pre = MessageFormat.format("<pre class=\"prettyprint linenums:{0,number,0}\">", line);
         }
      }
      return pre;
   }
   }
   
   /**
    * Simple class to track the results of an index update.