James Moger
2013-11-20 aa6d43e8b28ff73d69a920e9b3a7b284cfce00c3
src/main/java/com/gitblit/GitBlit.java
@@ -29,8 +29,6 @@
import java.lang.reflect.Type;
import java.net.URI;
import java.net.URISyntaxException;
import java.nio.charset.Charset;
import java.security.Principal;
import java.text.MessageFormat;
import java.text.SimpleDateFormat;
import java.util.ArrayList;
@@ -47,7 +45,6 @@
import java.util.Map;
import java.util.Map.Entry;
import java.util.Set;
import java.util.TimeZone;
import java.util.TreeMap;
import java.util.TreeSet;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
@@ -57,20 +54,13 @@
import java.util.concurrent.atomic.AtomicInteger;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicReference;
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
import javax.mail.internet.MimeBodyPart;
import javax.mail.internet.MimeMultipart;
import javax.naming.Context;
import javax.naming.InitialContext;
import javax.naming.NamingException;
import javax.servlet.ServletContext;
import javax.servlet.annotation.WebListener;
import javax.servlet.http.Cookie;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
import org.apache.wicket.RequestCycle;
import org.apache.wicket.resource.ContextRelativeResource;
import org.apache.wicket.util.resource.ResourceStreamNotFoundException;
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
@@ -85,8 +75,6 @@
import com.gitblit.Constants.AccessPermission;
import com.gitblit.Constants.AccessRestrictionType;
import com.gitblit.Constants.AccountType;
import com.gitblit.Constants.AuthenticationType;
import com.gitblit.Constants.AuthorizationControl;
import com.gitblit.Constants.CommitMessageRenderer;
import com.gitblit.Constants.FederationRequest;
@@ -102,6 +90,7 @@
import com.gitblit.git.GitServlet;
import com.gitblit.manager.IFederationManager;
import com.gitblit.manager.IGitblitManager;
import com.gitblit.manager.IManager;
import com.gitblit.manager.INotificationManager;
import com.gitblit.manager.IProjectManager;
import com.gitblit.manager.IRepositoryManager;
@@ -121,12 +110,10 @@
import com.gitblit.models.RepositoryUrl;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.models.ServerSettings;
import com.gitblit.models.ServerStatus;
import com.gitblit.models.SettingModel;
import com.gitblit.models.TeamModel;
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.Base64;
import com.gitblit.utils.ByteFormat;
import com.gitblit.utils.CommitCache;
import com.gitblit.utils.ContainerUtils;
@@ -142,14 +129,14 @@
import com.gitblit.utils.ObjectCache;
import com.gitblit.utils.StringUtils;
import com.gitblit.utils.TimeUtils;
import com.gitblit.utils.X509Utils.X509Metadata;
import com.gitblit.wicket.GitBlitWebSession;
import com.gitblit.wicket.GitblitWicketFilter;
import com.gitblit.wicket.WicketUtils;
import com.google.gson.Gson;
import com.google.gson.JsonIOException;
import com.google.gson.JsonSyntaxException;
import com.google.gson.reflect.TypeToken;
import dagger.ObjectGraph;
/**
 * GitBlit is the servlet context listener singleton that acts as the core for
@@ -165,11 +152,7 @@
 */
@WebListener
public class GitBlit extends DaggerContextListener
                implements IRuntimeManager,
                        INotificationManager,
                        IUserManager,
                        ISessionManager,
                        IRepositoryManager,
                implements IRepositoryManager,
                        IProjectManager,
                        IFederationManager,
                        IGitblitManager {
@@ -177,6 +160,10 @@
   private static GitBlit gitblit;
   private final IStoredSettings goSettings;
   private final File goBaseFolder;
   private final List<IManager> managers = new ArrayList<IManager>();
   private final ScheduledExecutorService scheduledExecutor = Executors.newScheduledThreadPool(10);
@@ -201,27 +188,15 @@
   private final ObjectCache<String> projectRepositoriesMarkdownCache = new ObjectCache<String>();
   private File baseFolder;
   private File repositoriesFolder;
   private IUserService userService;
   private IStoredSettings settings;
   private ServerSettings settingsModel;
   private ServerStatus serverStatus;
   private MailExecutor mailExecutor;
   private LuceneExecutor luceneExecutor;
   private GCExecutor gcExecutor;
   private MirrorExecutor mirrorExecutor;
   private TimeZone timezone;
   private FileBasedConfig projectConfigs;
@@ -231,17 +206,12 @@
   public GitBlit() {
      this.goSettings = null;
   }
   protected GitBlit(final IUserService userService) {
      this.goSettings = null;
      this.userService = userService;
      gitblit = this;
      this.goBaseFolder = null;
   }
   public GitBlit(IStoredSettings settings, File baseFolder) {
      this.goSettings = settings;
      this.baseFolder = baseFolder;
      this.goBaseFolder = baseFolder;
      gitblit = this;
   }
@@ -259,27 +229,13 @@
      if (managerClass.isAssignableFrom(GitBlit.class)) {
         return (X) gitblit;
      }
      for (IManager manager : gitblit.managers) {
         if (managerClass.isAssignableFrom(manager.getClass())) {
            return (X) manager;
         }
      }
      return null;
   }
   @Override
   public File getBaseFolder() {
      return baseFolder;
   }
   @Override
   public void setBaseFolder(File folder) {
      this.baseFolder = folder;
   }
   /**
    * Returns the boot date of the Gitblit server.
    *
    * @return the boot date of Gitblit
    */
   @Override
   public Date getBootDate() {
      return serverStatus.bootDate;
   }
   /**
@@ -302,71 +258,6 @@
   }
   /**
    * Determine if this Gitblit instance is actively serving git repositories
    * or if it is merely a repository viewer.
    *
    * @return true if Gitblit is serving repositories
    */
   @Override
   public boolean isServingRepositories() {
      return settings.getBoolean(Keys.git.enableGitServlet, true) || (settings.getInteger(Keys.git.daemonPort, 0) > 0);
   }
   /**
    * Returns the preferred timezone for the Gitblit instance.
    *
    * @return a timezone
    */
   @Override
   public TimeZone getTimezone() {
      if (timezone == null) {
         String tzid = settings.getString("web.timezone", null);
         if (StringUtils.isEmpty(tzid)) {
            timezone = TimeZone.getDefault();
            return timezone;
         }
         timezone = TimeZone.getTimeZone(tzid);
      }
      return timezone;
   }
   /**
    * Is Gitblit running in debug mode?
    *
    * @return true if Gitblit is running in debug mode
    */
   @Override
   public boolean isDebugMode() {
      return settings.getBoolean(Keys.web.debugMode, false);
   }
   /**
    * Returns the file object for the specified configuration key.
    *
    * @return the file
    */
   @Override
   public File getFileOrFolder(String key, String defaultFileOrFolder) {
      String fileOrFolder = settings.getString(key, defaultFileOrFolder);
      return getFileOrFolder(fileOrFolder);
   }
   /**
    * Returns the file object which may have it's base-path determined by
    * environment variables for running on a cloud hosting service. All Gitblit
    * file or folder retrievals are (at least initially) funneled through this
    * method so it is the correct point to globally override/alter filesystem
    * access based on environment or some other indicator.
    *
    * @return the file
    */
   @Override
   public File getFileOrFolder(String fileOrFolder) {
      return com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.baseFolder$,
            baseFolder, fileOrFolder);
   }
   /**
    * Returns the path of the repositories folder. This method checks to see if
    * Gitblit is running on a cloud service and may return an adjusted path.
    *
@@ -374,7 +265,7 @@
    */
   @Override
   public File getRepositoriesFolder() {
      return getFileOrFolder(Keys.git.repositoriesFolder, "${baseFolder}/git");
      return getManager(IRuntimeManager.class).getFileOrFolder(Keys.git.repositoriesFolder, "${baseFolder}/git");
   }
   /**
@@ -385,7 +276,7 @@
    */
   @Override
   public File getProposalsFolder() {
      return getFileOrFolder(Keys.federation.proposalsFolder, "${baseFolder}/proposals");
      return getManager(IRuntimeManager.class).getFileOrFolder(Keys.federation.proposalsFolder, "${baseFolder}/proposals");
   }
   /**
@@ -396,7 +287,7 @@
    */
   @Override
   public File getHooksFolder() {
      return getFileOrFolder(Keys.groovy.scriptsFolder, "${baseFolder}/groovy");
      return getManager(IRuntimeManager.class).getFileOrFolder(Keys.groovy.scriptsFolder, "${baseFolder}/groovy");
   }
   /**
@@ -407,36 +298,7 @@
    */
   @Override
   public File getGrapesFolder() {
      return getFileOrFolder(Keys.groovy.grapeFolder, "${baseFolder}/groovy/grape");
   }
   /**
    * Returns the runtime settings.
    *
    * @return runtime settings
    */
   @Override
   public IStoredSettings getSettings() {
      return settings;
   }
   /**
    * Updates the runtime settings.
    *
    * @param settings
    * @return true if the update succeeded
    */
   @Override
   public boolean updateSettings(Map<String, String> updatedSettings) {
      return settings.saveSettings(updatedSettings);
   }
   @Override
   public ServerStatus getStatus() {
      // update heap memory status
      serverStatus.heapAllocated = Runtime.getRuntime().totalMemory();
      serverStatus.heapFree = Runtime.getRuntime().freeMemory();
      return serverStatus;
      return getManager(IRuntimeManager.class).getFileOrFolder(Keys.groovy.grapeFolder, "${baseFolder}/groovy/grape");
   }
   /**
@@ -452,7 +314,7 @@
      if (user == null) {
         user = UserModel.ANONYMOUS;
      }
      String username = encodeUsername(UserModel.ANONYMOUS.equals(user) ? "" : user.username);
      String username = StringUtils.encodeUsername(UserModel.ANONYMOUS.equals(user) ? "" : user.username);
      List<RepositoryUrl> list = new ArrayList<RepositoryUrl>();
      // http/https url
@@ -548,7 +410,7 @@
   @Override
   public Collection<GitClientApplication> getClientApplications() {
      // prefer user definitions, if they exist
      File userDefs = new File(baseFolder, "clientapps.json");
      File userDefs = new File(getManager(IRuntimeManager.class).getBaseFolder(), "clientapps.json");
      if (userDefs.exists()) {
         Date lastModified = new Date(userDefs.lastModified());
         if (clientApplications.hasCurrent("user", lastModified)) {
@@ -603,276 +465,6 @@
   }
   /**
    * Set the user service. The user service authenticates all users and is
    * responsible for managing user permissions.
    *
    * @param userService
    */
   public void setUserService(IUserService userService) {
      logger.info("Setting up user service " + userService.toString());
      this.userService = userService;
      this.userService.setup(getManager(IRuntimeManager.class));
   }
   @Override
   public boolean supportsAddUser() {
      return supportsCredentialChanges(new UserModel(""));
   }
   /**
    * Returns true if the user's credentials can be changed.
    *
    * @param user
    * @return true if the user service supports credential changes
    */
   @Override
   public boolean supportsCredentialChanges(UserModel user) {
      if (user == null) {
         return false;
      } else if (AccountType.LOCAL.equals(user.accountType)) {
         // local account, we can change credentials
         return true;
      } else {
         // external account, ask user service
         return userService.supportsCredentialChanges();
      }
   }
   /**
    * Returns true if the user's display name can be changed.
    *
    * @param user
    * @return true if the user service supports display name changes
    */
   @Override
   public boolean supportsDisplayNameChanges(UserModel user) {
      return (user != null && user.isLocalAccount()) || userService.supportsDisplayNameChanges();
   }
   /**
    * Returns true if the user's email address can be changed.
    *
    * @param user
    * @return true if the user service supports email address changes
    */
   @Override
   public boolean supportsEmailAddressChanges(UserModel user) {
      return (user != null && user.isLocalAccount()) || userService.supportsEmailAddressChanges();
   }
   /**
    * Returns true if the user's team memberships can be changed.
    *
    * @param user
    * @return true if the user service supports team membership changes
    */
   @Override
   public boolean supportsTeamMembershipChanges(UserModel user) {
      return (user != null && user.isLocalAccount()) || userService.supportsTeamMembershipChanges();
   }
   /**
    * Returns true if the username represents an internal account
    *
    * @param username
    * @return true if the specified username represents an internal account
    */
   protected boolean isInternalAccount(String username) {
      return !StringUtils.isEmpty(username)
            && (username.equalsIgnoreCase(Constants.FEDERATION_USER)
                  || username.equalsIgnoreCase(UserModel.ANONYMOUS.username));
   }
   /**
    * Authenticate a user based on a username and password.
    *
    * @see IUserService.authenticate(String, char[])
    * @param username
    * @param password
    * @return a user object or null
    */
   @Override
   public UserModel authenticate(String username, char[] password) {
      if (StringUtils.isEmpty(username)) {
         // can not authenticate empty username
         return null;
      }
      String usernameDecoded = decodeUsername(username);
      String pw = new String(password);
      if (StringUtils.isEmpty(pw)) {
         // can not authenticate empty password
         return null;
      }
      // check to see if this is the federation user
      if (canFederate()) {
         if (usernameDecoded.equalsIgnoreCase(Constants.FEDERATION_USER)) {
            List<String> tokens = getFederationTokens();
            if (tokens.contains(pw)) {
               return getFederationUser();
            }
         }
      }
      // delegate authentication to the user service
      if (userService == null) {
         return null;
      }
      return userService.authenticate(usernameDecoded, password);
   }
   /**
    * Authenticate a user based on their cookie.
    *
    * @param cookies
    * @return a user object or null
    */
   protected UserModel authenticate(Cookie[] cookies) {
      if (userService == null) {
         return null;
      }
      if (userService.supportsCookies()) {
         if (cookies != null && cookies.length > 0) {
            for (Cookie cookie : cookies) {
               if (cookie.getName().equals(Constants.NAME)) {
                  String value = cookie.getValue();
                  return userService.authenticate(value.toCharArray());
               }
            }
         }
      }
      return null;
   }
   /**
    * Authenticate a user based on HTTP request parameters.
    *
    * Authentication by X509Certificate is tried first and then by cookie.
    *
    * @param httpRequest
    * @return a user object or null
    */
   @Override
   public UserModel authenticate(HttpServletRequest httpRequest) {
      return authenticate(httpRequest, false);
   }
   /**
    * Authenticate a user based on HTTP request parameters.
    *
    * Authentication by X509Certificate, servlet container principal, cookie,
    * and BASIC header.
    *
    * @param httpRequest
    * @param requiresCertificate
    * @return a user object or null
    */
   @Override
   public UserModel authenticate(HttpServletRequest httpRequest, boolean requiresCertificate) {
      // try to authenticate by certificate
      boolean checkValidity = settings.getBoolean(Keys.git.enforceCertificateValidity, true);
      String [] oids = settings.getStrings(Keys.git.certificateUsernameOIDs).toArray(new String[0]);
      UserModel model = HttpUtils.getUserModelFromCertificate(httpRequest, checkValidity, oids);
      if (model != null) {
         // grab real user model and preserve certificate serial number
         UserModel user = getUserModel(model.username);
         X509Metadata metadata = HttpUtils.getCertificateMetadata(httpRequest);
         if (user != null) {
            flagWicketSession(AuthenticationType.CERTIFICATE);
            logger.debug(MessageFormat.format("{0} authenticated by client certificate {1} from {2}",
                  user.username, metadata.serialNumber, httpRequest.getRemoteAddr()));
            return user;
         } else {
            logger.warn(MessageFormat.format("Failed to find UserModel for {0}, attempted client certificate ({1}) authentication from {2}",
                  model.username, metadata.serialNumber, httpRequest.getRemoteAddr()));
         }
      }
      if (requiresCertificate) {
         // caller requires client certificate authentication (e.g. git servlet)
         return null;
      }
      // try to authenticate by servlet container principal
      Principal principal = httpRequest.getUserPrincipal();
      if (principal != null) {
         String username = principal.getName();
         if (!StringUtils.isEmpty(username)) {
            boolean internalAccount = isInternalAccount(username);
            UserModel user = getUserModel(username);
            if (user != null) {
               // existing user
               flagWicketSession(AuthenticationType.CONTAINER);
               logger.debug(MessageFormat.format("{0} authenticated by servlet container principal from {1}",
                     user.username, httpRequest.getRemoteAddr()));
               return user;
            } else if (settings.getBoolean(Keys.realm.container.autoCreateAccounts, false)
                  && !internalAccount) {
               // auto-create user from an authenticated container principal
               user = new UserModel(username.toLowerCase());
               user.displayName = username;
               user.password = Constants.EXTERNAL_ACCOUNT;
               userService.updateUserModel(user);
               flagWicketSession(AuthenticationType.CONTAINER);
               logger.debug(MessageFormat.format("{0} authenticated and created by servlet container principal from {1}",
                     user.username, httpRequest.getRemoteAddr()));
               return user;
            } else if (!internalAccount) {
               logger.warn(MessageFormat.format("Failed to find UserModel for {0}, attempted servlet container authentication from {1}",
                     principal.getName(), httpRequest.getRemoteAddr()));
            }
         }
      }
      // try to authenticate by cookie
      if (supportsCookies()) {
         UserModel user = authenticate(httpRequest.getCookies());
         if (user != null) {
            flagWicketSession(AuthenticationType.COOKIE);
            logger.debug(MessageFormat.format("{0} authenticated by cookie from {1}",
                  user.username, httpRequest.getRemoteAddr()));
            return user;
         }
      }
      // try to authenticate by BASIC
      final String authorization = httpRequest.getHeader("Authorization");
      if (authorization != null && authorization.startsWith("Basic")) {
         // Authorization: Basic base64credentials
         String base64Credentials = authorization.substring("Basic".length()).trim();
         String credentials = new String(Base64.decode(base64Credentials),
               Charset.forName("UTF-8"));
         // credentials = username:password
         final String[] values = credentials.split(":",2);
         if (values.length == 2) {
            String username = values[0];
            char[] password = values[1].toCharArray();
            UserModel user = authenticate(username, password);
            if (user != null) {
               flagWicketSession(AuthenticationType.CREDENTIALS);
               logger.debug(MessageFormat.format("{0} authenticated by BASIC request header from {1}",
                     user.username, httpRequest.getRemoteAddr()));
               return user;
            } else {
               logger.warn(MessageFormat.format("Failed login attempt for {0}, invalid credentials from {1}",
                     username, httpRequest.getRemoteAddr()));
            }
         }
      }
      return null;
   }
   protected void flagWicketSession(AuthenticationType authenticationType) {
      RequestCycle requestCycle = RequestCycle.get();
      if (requestCycle != null) {
         // flag the Wicket session, if this is a Wicket request
         GitBlitWebSession session = GitBlitWebSession.get();
         session.authenticationType = authenticationType;
      }
   }
   /**
    * Open a file resource using the Servlet container.
    * @param file to open
    * @return InputStream of the opened file
@@ -883,138 +475,12 @@
      return res.getResourceStream().getInputStream();
   }
   /**
    * Sets a cookie for the specified user.
    *
    * @param response
    * @param user
    */
   @Override
   public void setCookie(HttpServletResponse response, UserModel user) {
      if (userService == null) {
         return;
      }
      GitBlitWebSession session = GitBlitWebSession.get();
      boolean standardLogin = session.authenticationType.isStandard();
      if (userService.supportsCookies() && standardLogin) {
         Cookie userCookie;
         if (user == null) {
            // clear cookie for logout
            userCookie = new Cookie(Constants.NAME, "");
         } else {
            // set cookie for login
            String cookie = userService.getCookie(user);
            if (StringUtils.isEmpty(cookie)) {
               // create empty cookie
               userCookie = new Cookie(Constants.NAME, "");
            } else {
               // create real cookie
               userCookie = new Cookie(Constants.NAME, cookie);
               userCookie.setMaxAge(Integer.MAX_VALUE);
            }
         }
         userCookie.setPath("/");
         response.addCookie(userCookie);
      }
   }
   /**
    * Logout a user.
    *
    * @param user
    */
   @Override
   public void logout(UserModel user) {
      if (userService == null) {
         return;
      }
      userService.logout(user);
   }
   /**
    * Encode the username for user in an url.
    *
    * @param name
    * @return the encoded name
    */
   protected String encodeUsername(String name) {
      return name.replace("@", "%40").replace(" ", "%20").replace("\\", "%5C");
   }
   /**
    * Decode a username from an encoded url.
    *
    * @param name
    * @return the decoded name
    */
   protected String decodeUsername(String name) {
      return name.replace("%40", "@").replace("%20", " ").replace("%5C", "\\");
   }
   /**
    * Returns the list of all users available to the login service.
    *
    * @see IUserService.getAllUsernames()
    * @return list of all usernames
    */
   @Override
   public List<String> getAllUsernames() {
      List<String> names = new ArrayList<String>(userService.getAllUsernames());
      return names;
   }
   /**
    * Returns the list of all users available to the login service.
    *
    * @see IUserService.getAllUsernames()
    * @return list of all usernames
    */
   @Override
   public List<UserModel> getAllUsers() {
      List<UserModel> users = userService.getAllUsers();
      return users;
   }
   /**
    * Delete the user object with the specified username
    *
    * @see IUserService.deleteUser(String)
    * @param username
    * @return true if successful
    */
   @Override
   public boolean deleteUser(String username) {
      if (StringUtils.isEmpty(username)) {
         return false;
      }
      String usernameDecoded = decodeUsername(username);
      return userService.deleteUser(usernameDecoded);
   }
   @Override
   public UserModel getFederationUser() {
      // the federation user is an administrator
      UserModel federationUser = new UserModel(Constants.FEDERATION_USER);
      federationUser.canAdmin = true;
      return federationUser;
   }
   /**
    * Retrieve the user object for the specified username.
    *
    * @see IUserService.getUserModel(String)
    * @param username
    * @return a user object or null
    */
   @Override
   public UserModel getUserModel(String username) {
      if (StringUtils.isEmpty(username)) {
         return null;
      }
      String usernameDecoded = decodeUsername(username);
      UserModel user = userService.getUserModel(usernameDecoded);
      return user;
   }
   /**
@@ -1082,7 +548,7 @@
         return list;
      }
      // NAMED users and teams
      for (UserModel user : userService.getAllUsers()) {
      for (UserModel user : getManager(IUserManager.class).getAllUsers()) {
         RegistrantAccessPermission ap = user.getRepositoryPermission(repository);
         if (ap.permission.exceeds(AccessPermission.NONE)) {
            list.add(ap);
@@ -1104,12 +570,12 @@
      for (RegistrantAccessPermission up : permissions) {
         if (up.mutable) {
            // only set editable defined permissions
            UserModel user = userService.getUserModel(up.registrant);
            UserModel user = getManager(IUserManager.class).getUserModel(up.registrant);
            user.setRepositoryPermission(repository.name, up.permission);
            users.add(user);
         }
      }
      return userService.updateUserModels(users);
      return getManager(IUserManager.class).updateUserModels(users);
   }
   /**
@@ -1122,7 +588,7 @@
    */
   @Override
   public List<String> getRepositoryUsers(RepositoryModel repository) {
      return userService.getUsernamesForRepositoryRole(repository.name);
      return getManager(IUserManager.class).getUsernamesForRepositoryRole(repository.name);
   }
   /**
@@ -1155,7 +621,7 @@
   public void updateUserModel(String username, UserModel user, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      if (!username.equalsIgnoreCase(user.username)) {
         if (userService.getUserModel(user.username) != null) {
         if (getManager(IUserManager.class).getUserModel(user.username) != null) {
            throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                  "Failed to rename ''{0}'' because ''{1}'' already exists.", username,
                  user.username));
@@ -1177,43 +643,9 @@
            }
         }
      }
      if (!userService.updateUserModel(username, user)) {
      if (!getManager(IUserManager.class).updateUserModel(username, user)) {
         throw new GitBlitException(isCreate ? "Failed to add user!" : "Failed to update user!");
      }
   }
   /**
    * Returns the list of available teams that a user or repository may be
    * assigned to.
    *
    * @return the list of teams
    */
   public List<String> getAllTeamnames() {
      List<String> teams = new ArrayList<String>(userService.getAllTeamNames());
      return teams;
   }
   /**
    * Returns the list of available teams that a user or repository may be
    * assigned to.
    *
    * @return the list of teams
    */
   @Override
   public List<TeamModel> getAllTeams() {
      List<TeamModel> teams = userService.getAllTeams();
      return teams;
   }
   /**
    * Returns the TeamModel object for the specified name.
    *
    * @param teamname
    * @return a TeamModel object or null
    */
   @Override
   public TeamModel getTeamModel(String teamname) {
      return userService.getTeamModel(teamname);
   }
   /**
@@ -1227,7 +659,7 @@
   @Override
   public List<RegistrantAccessPermission> getTeamAccessPermissions(RepositoryModel repository) {
      List<RegistrantAccessPermission> list = new ArrayList<RegistrantAccessPermission>();
      for (TeamModel team : userService.getAllTeams()) {
      for (TeamModel team : getManager(IUserManager.class).getAllTeams()) {
         RegistrantAccessPermission ap = team.getRepositoryPermission(repository);
         if (ap.permission.exceeds(AccessPermission.NONE)) {
            list.add(ap);
@@ -1250,12 +682,12 @@
      for (RegistrantAccessPermission tp : permissions) {
         if (tp.mutable) {
            // only set explicitly defined access permissions
            TeamModel team = userService.getTeamModel(tp.registrant);
            TeamModel team = getManager(IUserManager.class).getTeamModel(tp.registrant);
            team.setRepositoryPermission(repository.name, tp.permission);
            teams.add(team);
         }
      }
      return userService.updateTeamModels(teams);
      return getManager(IUserManager.class).updateTeamModels(teams);
   }
   /**
@@ -1268,7 +700,7 @@
    */
   @Override
   public List<String> getRepositoryTeams(RepositoryModel repository) {
      return userService.getTeamnamesForRepositoryRole(repository.name);
      return getManager(IUserManager.class).getTeamNamesForRepositoryRole(repository.name);
   }
   /**
@@ -1298,27 +730,15 @@
   public void updateTeamModel(String teamname, TeamModel team, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      if (!teamname.equalsIgnoreCase(team.name)) {
         if (userService.getTeamModel(team.name) != null) {
         if (getManager(IUserManager.class).getTeamModel(team.name) != null) {
            throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                  "Failed to rename ''{0}'' because ''{1}'' already exists.", teamname,
                  team.name));
         }
      }
      if (!userService.updateTeamModel(teamname, team)) {
      if (!getManager(IUserManager.class).updateTeamModel(teamname, team)) {
         throw new GitBlitException(isCreate ? "Failed to add team!" : "Failed to update team!");
      }
   }
   /**
    * Delete the team object with the specified teamname
    *
    * @see IUserService.deleteTeam(String)
    * @param teamname
    * @return true if successful
    */
   @Override
   public boolean deleteTeam(String teamname) {
      return userService.deleteTeam(teamname);
   }
   /**
@@ -1636,7 +1056,7 @@
   @Override
   public long getStarCount(RepositoryModel repository) {
      long count = 0;
      for (UserModel user : getAllUsers()) {
      for (UserModel user : getManager(IUserManager.class).getAllUsers()) {
         if (user.getPreferences().isStarredRepository(repository.name)) {
            count++;
         }
@@ -1797,7 +1217,7 @@
      if (project == null) {
         project = new ProjectModel(name);
         if (ModelUtils.isPersonalRepository(name)) {
            UserModel user = getUserModel(ModelUtils.getUserNameFromRepoPath(name));
            UserModel user = getManager(IUserManager.class).getUserModel(ModelUtils.getUserNameFromRepoPath(name));
            if (user != null) {
               project.title = user.getDisplayName();
               project.description = "personal repositories";
@@ -1912,7 +1332,7 @@
      }
      RepositoryModel model = new RepositoryModel();
      model.isBare = r.isBare();
      File basePath = getFileOrFolder(Keys.git.repositoriesFolder, "${baseFolder}/git");
      File basePath = getRepositoriesFolder();
      if (model.isBare) {
         model.name = com.gitblit.utils.FileUtils.getRelativePath(basePath, r.getDirectory());
      } else {
@@ -2283,7 +1703,7 @@
      if (repositoryMetricsCache.hasCurrent(model.name, model.lastChange)) {
         return new ArrayList<Metric>(repositoryMetricsCache.getObject(model.name));
      }
      List<Metric> metrics = MetricUtils.getDateMetrics(repository, null, true, null, getTimezone());
      List<Metric> metrics = MetricUtils.getDateMetrics(repository, null, true, null, getManager(IRuntimeManager.class).getTimezone());
      repositoryMetricsCache.updateObject(model.name, model.lastChange, metrics);
      return new ArrayList<Metric>(metrics);
   }
@@ -2414,7 +1834,7 @@
                     repository.name));
            }
            // rename the roles
            if (!userService.renameRepositoryRole(repositoryName, repository.name)) {
            if (!getManager(IUserManager.class).renameRepositoryRole(repositoryName, repository.name)) {
               throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                     "Failed to rename repository permissions ''{0}'' to ''{1}''.",
                     repositoryName, repository.name));
@@ -2631,7 +2051,7 @@
         File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
         if (folder.exists() && folder.isDirectory()) {
            FileUtils.delete(folder, FileUtils.RECURSIVE | FileUtils.RETRY);
            if (userService.deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
            if (getManager(IUserManager.class).deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
               logger.info(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" deleted", repositoryName));
               return true;
            }
@@ -2970,7 +2390,7 @@
      }
      // send an email, if possible
      sendMailToAdministrators("Federation proposal from " + proposal.url,
      getManager(INotificationManager.class).sendMailToAdministrators("Federation proposal from " + proposal.url,
            "Please review the proposal @ " + gitblitUrl + "/proposal/" + proposal.token);
      return true;
   }
@@ -3163,8 +2583,8 @@
      // Team Scripts
      if (repository != null) {
         for (String teamname : userService.getTeamnamesForRepositoryRole(repository.name)) {
            TeamModel team = userService.getTeamModel(teamname);
         for (String teamname : getManager(IUserManager.class).getTeamNamesForRepositoryRole(repository.name)) {
            TeamModel team = getManager(IUserManager.class).getTeamModel(teamname);
            if (!ArrayUtils.isEmpty(team.preReceiveScripts)) {
               scripts.addAll(team.preReceiveScripts);
            }
@@ -3217,8 +2637,8 @@
      }
      // Team Scripts
      if (repository != null) {
         for (String teamname : userService.getTeamnamesForRepositoryRole(repository.name)) {
            TeamModel team = userService.getTeamModel(teamname);
         for (String teamname : getManager(IUserManager.class).getTeamNamesForRepositoryRole(repository.name)) {
            TeamModel team = getManager(IUserManager.class).getTeamModel(teamname);
            if (!ArrayUtils.isEmpty(team.postReceiveScripts)) {
               scripts.addAll(team.postReceiveScripts);
            }
@@ -3266,144 +2686,21 @@
   }
   /**
    * Notify the administrators by email.
    *
    * @param subject
    * @param message
    */
   @Override
   public void sendMailToAdministrators(String subject, String message) {
      List<String> toAddresses = settings.getStrings(Keys.mail.adminAddresses);
      sendMail(subject, message, toAddresses);
   }
   /**
    * Notify users by email of something.
    *
    * @param subject
    * @param message
    * @param toAddresses
    */
   @Override
   public void sendMail(String subject, String message, Collection<String> toAddresses) {
      this.sendMail(subject, message, toAddresses.toArray(new String[0]));
   }
   /**
    * Notify users by email of something.
    *
    * @param subject
    * @param message
    * @param toAddresses
    */
   @Override
   public void sendMail(String subject, String message, String... toAddresses) {
      if (toAddresses == null || toAddresses.length == 0) {
         logger.debug(MessageFormat.format("Dropping message {0} because there are no recipients", subject));
         return;
      }
      try {
         Message mail = mailExecutor.createMessage(toAddresses);
         if (mail != null) {
            mail.setSubject(subject);
            MimeBodyPart messagePart = new MimeBodyPart();
            messagePart.setText(message, "utf-8");
            messagePart.setHeader("Content-Type", "text/plain; charset=\"utf-8\"");
            messagePart.setHeader("Content-Transfer-Encoding", "quoted-printable");
            MimeMultipart multiPart = new MimeMultipart();
            multiPart.addBodyPart(messagePart);
            mail.setContent(multiPart);
            mailExecutor.queue(mail);
         }
      } catch (MessagingException e) {
         logger.error("Messaging error", e);
      }
   }
   /**
    * Notify users by email of something.
    *
    * @param subject
    * @param message
    * @param toAddresses
    */
   @Override
   public void sendHtmlMail(String subject, String message, Collection<String> toAddresses) {
      this.sendHtmlMail(subject, message, toAddresses.toArray(new String[0]));
   }
   /**
    * Notify users by email of something.
    *
    * @param subject
    * @param message
    * @param toAddresses
    */
   @Override
   public void sendHtmlMail(String subject, String message, String... toAddresses) {
      if (toAddresses == null || toAddresses.length == 0) {
         logger.debug(MessageFormat.format("Dropping message {0} because there are no recipients", subject));
         return;
      }
      try {
         Message mail = mailExecutor.createMessage(toAddresses);
         if (mail != null) {
            mail.setSubject(subject);
            MimeBodyPart messagePart = new MimeBodyPart();
            messagePart.setText(message, "utf-8");
            messagePart.setHeader("Content-Type", "text/html; charset=\"utf-8\"");
            messagePart.setHeader("Content-Transfer-Encoding", "quoted-printable");
            MimeMultipart multiPart = new MimeMultipart();
            multiPart.addBodyPart(messagePart);
            mail.setContent(multiPart);
            mailExecutor.queue(mail);
         }
      } catch (MessagingException e) {
         logger.error("Messaging error", e);
      }
   }
   /**
    * Returns the descriptions/comments of the Gitblit config settings.
    *
    * @return SettingsModel
    */
   @Override
   public ServerSettings getSettingsModel() {
      // ensure that the current values are updated in the setting models
      for (String key : settings.getAllKeys(null)) {
         SettingModel setting = settingsModel.get(key);
         if (setting == null) {
            // unreferenced setting, create a setting model
            setting = new SettingModel();
            setting.name = key;
            settingsModel.add(setting);
         }
         setting.currentValue = settings.getString(key, "");
      }
      settingsModel.pushScripts = getAllScripts();
      return settingsModel;
   }
   /**
    * Parse the properties file and aggregate all the comments by the setting
    * key. A setting model tracks the current value, the default value, the
    * description of the setting and and directives about the setting.
    *
    * @return Map<String, SettingModel>
    */
   private ServerSettings loadSettingModels() {
      ServerSettings settingsModel = new ServerSettings();
      settingsModel.supportsCredentialChanges = userService.supportsCredentialChanges();
      settingsModel.supportsDisplayNameChanges = userService.supportsDisplayNameChanges();
      settingsModel.supportsEmailAddressChanges = userService.supportsEmailAddressChanges();
      settingsModel.supportsTeamMembershipChanges = userService.supportsTeamMembershipChanges();
   private ServerSettings loadSettingModels(ServerSettings settingsModel) {
      // this entire "supports" concept will go away with user service refactoring
      UserModel externalUser = new UserModel(Constants.EXTERNAL_ACCOUNT);
      externalUser.password = Constants.EXTERNAL_ACCOUNT;
      IUserManager userManager = getManager(IUserManager.class);
      settingsModel.supportsCredentialChanges = userManager.supportsCredentialChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsDisplayNameChanges = userManager.supportsDisplayNameChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsEmailAddressChanges = userManager.supportsEmailAddressChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsTeamMembershipChanges = userManager.supportsTeamMembershipChanges(externalUser);
      try {
         // Read bundled Gitblit properties to extract setting descriptions.
         // This copy is pristine and only used for populating the setting
@@ -3458,86 +2755,6 @@
         logger.error("Failed to load resource copy of gitblit.properties");
      }
      return settingsModel;
   }
   /**
    * Configure the Gitblit singleton with the specified settings source. This
    * source may be file settings (Gitblit GO) or may be web.xml settings
    * (Gitblit WAR).
    *
    * @param settings
    */
   public void configureContext(IStoredSettings settings, File folder, boolean startFederation) {
      this.settings = settings;
      this.baseFolder = folder;
      repositoriesFolder = getRepositoriesFolder();
      logger.info("Gitblit base folder     = " + folder.getAbsolutePath());
      logger.info("Git repositories folder = " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
      logger.info("Gitblit settings        = " + settings.toString());
      // prepare service executors
      mailExecutor = new MailExecutor(settings);
      luceneExecutor = new LuceneExecutor(settings, getManager(IRepositoryManager.class));
      gcExecutor = new GCExecutor(settings, getManager(IRepositoryManager.class));
      mirrorExecutor = new MirrorExecutor(settings, getManager(IRepositoryManager.class));
      // initialize utilities
      String prefix = settings.getString(Keys.git.userRepositoryPrefix, "~");
      ModelUtils.setUserRepoPrefix(prefix);
      // calculate repository list settings checksum for future config changes
      repositoryListSettingsChecksum.set(getRepositoryListSettingsChecksum());
      // build initial repository list
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Identifying available repositories...");
         getRepositoryList();
      }
      logTimezone("JVM", TimeZone.getDefault());
      logTimezone(Constants.NAME, getTimezone());
      serverStatus = new ServerStatus(goSettings != null);
      if (this.userService == null) {
         String realm = settings.getString(Keys.realm.userService, "${baseFolder}/users.properties");
         IUserService loginService = null;
         try {
            // check to see if this "file" is a login service class
            Class<?> realmClass = Class.forName(realm);
            loginService = (IUserService) realmClass.newInstance();
         } catch (Throwable t) {
            loginService = new GitblitUserService();
         }
         setUserService(loginService);
      }
      // load and cache the project metadata
      projectConfigs = new FileBasedConfig(getFileOrFolder(Keys.web.projectsFile, "${baseFolder}/projects.conf"), FS.detect());
      getProjectConfigs();
      configureMailExecutor();
      configureLuceneIndexing();
      configureGarbageCollector();
      configureMirrorExecutor();
      if (startFederation) {
         configureFederation();
      }
      configureJGit();
      configureFanout();
      configureGitDaemon();
      configureCommitCache();
   }
   protected void configureMailExecutor() {
      if (mailExecutor.isReady()) {
         logger.info("Mail executor is scheduled to process the message queue every 2 minutes.");
         scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(mailExecutor, 1, 2, TimeUnit.MINUTES);
      } else {
         logger.warn("Mail server is not properly configured.  Mail services disabled.");
      }
   }
   protected void configureLuceneIndexing() {
@@ -3641,7 +2858,17 @@
      String bindInterface = settings.getString(Keys.git.daemonBindInterface, "localhost");
      if (port > 0) {
         try {
            gitDaemon = new GitDaemon(this, this, this, this);
            // HACK temporary pending manager separation and injection
            Gitblit gitblit = new Gitblit(
                  getManager(IRuntimeManager.class),
                  getManager(INotificationManager.class),
                  getManager(IUserManager.class),
                  getManager(ISessionManager.class),
                  this,
                  this,
                  this,
                  this);
            gitDaemon = new GitDaemon(gitblit);
            gitDaemon.start();
         } catch (IOException e) {
            gitDaemon = null;
@@ -3698,13 +2925,6 @@
      return luceneExecutor;
   }
   private void logTimezone(String type, TimeZone zone) {
      SimpleDateFormat df = new SimpleDateFormat("z Z");
      df.setTimeZone(zone);
      String offset = df.format(new Date());
      logger.info(type + " timezone is " + zone.getID() + " (" + offset + ")");
   }
   /**
    * Configure Gitblit from the web.xml, if no configuration has already been
    * specified.
@@ -3713,93 +2933,226 @@
    */
   @Override
   protected void beforeServletInjection(ServletContext context) {
      if (settings == null) {
         // Gitblit is running in a servlet container
      ObjectGraph injector = getInjector(context);
      // create the runtime settings object
      IStoredSettings runtimeSettings = injector.get(IStoredSettings.class);
      this.settings = runtimeSettings; // XXX remove me eventually
      final File baseFolder;
      if (goSettings != null) {
         // Gitblit GO
         logger.debug("configuring Gitblit GO");
         baseFolder = configureGO(context, goSettings, goBaseFolder, runtimeSettings);
      } else {
         // servlet container
         WebXmlSettings webxmlSettings = new WebXmlSettings(context);
         String contextRealPath = context.getRealPath("/");
         File contextFolder = (contextRealPath != null) ? new File(contextRealPath) : null;
         String openShift = System.getenv("OPENSHIFT_DATA_DIR");
         if (!StringUtils.isEmpty(openShift)) {
            // Gitblit is running in OpenShift/JBoss
            File base = new File(openShift);
            logger.info("EXPRESS contextFolder is " + contextFolder.getAbsolutePath());
            // gitblit.properties setting overrides
            File overrideFile = new File(base, "gitblit.properties");
            webxmlSettings.applyOverrides(overrideFile);
            // Copy the included scripts to the configured groovy folder
            String path = webxmlSettings.getString(Keys.groovy.scriptsFolder, "groovy");
            File localScripts = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.baseFolder$, base, path);
            if (!localScripts.exists()) {
               File warScripts = new File(contextFolder, "/WEB-INF/data/groovy");
               if (!warScripts.equals(localScripts)) {
                  try {
                     com.gitblit.utils.FileUtils.copy(localScripts, warScripts.listFiles());
                  } catch (IOException e) {
                     logger.error(MessageFormat.format(
                           "Failed to copy included Groovy scripts from {0} to {1}",
                           warScripts, localScripts));
                  }
               }
            }
            // disable Git daemon on Express - we can't bind 9418 and we
            // can't port-forward to the daemon
            webxmlSettings.overrideSetting(Keys.git.daemonPort, 0);
            // configure context using the web.xml
            configureContext(webxmlSettings, base, true);
         if (!StringUtils.isEmpty(System.getenv("OPENSHIFT_DATA_DIR"))) {
            // RedHat OpenShift
            logger.debug("configuring Gitblit Express");
            baseFolder = configureExpress(context, webxmlSettings, contextFolder, runtimeSettings);
         } else {
            // Gitblit is running in a standard servlet container
            logger.info("WAR contextFolder is " + ((contextFolder != null) ? contextFolder.getAbsolutePath() : "<empty>"));
            String path = webxmlSettings.getString(Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$ + "/WEB-INF/data");
            if (path.contains(Constants.contextFolder$) && contextFolder == null) {
               // warn about null contextFolder (issue-199)
               logger.error("");
               logger.error(MessageFormat.format("\"{0}\" depends on \"{1}\" but \"{2}\" is returning NULL for \"{1}\"!",
                     Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$, context.getServerInfo()));
               logger.error(MessageFormat.format("Please specify a non-parameterized path for <context-param> {0} in web.xml!!", Constants.baseFolder));
               logger.error(MessageFormat.format("OR configure your servlet container to specify a \"{0}\" parameter in the context configuration!!", Constants.baseFolder));
               logger.error("");
            }
            try {
               // try to lookup JNDI env-entry for the baseFolder
               InitialContext ic = new InitialContext();
               Context env = (Context) ic.lookup("java:comp/env");
               String val = (String) env.lookup("baseFolder");
               if (!StringUtils.isEmpty(val)) {
                  path = val;
               }
            } catch (NamingException n) {
               logger.error("Failed to get JNDI env-entry: " + n.getExplanation());
            }
            File base = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.contextFolder$, contextFolder, path);
            base.mkdirs();
            // try to extract the data folder resource to the baseFolder
            File localSettings = new File(base, "gitblit.properties");
            if (!localSettings.exists()) {
               extractResources(context, "/WEB-INF/data/", base);
            }
            // delegate all config to baseFolder/gitblit.properties file
            FileSettings settings = new FileSettings(localSettings.getAbsolutePath());
            configureContext(settings, base, true);
            // standard WAR
            logger.debug("configuring Gitblit WAR");
            baseFolder = configureWAR(context, webxmlSettings, contextFolder, runtimeSettings);
         }
         // WAR or Express is likely to be running on a Tomcat.
         // Test for the forward-slash/%2F issue and auto-adjust settings.
         ContainerUtils.CVE_2007_0450.test(settings);
         // Test for Tomcat forward-slash/%2F issue and auto-adjust settings
         ContainerUtils.CVE_2007_0450.test(runtimeSettings);
      }
      settingsModel = loadSettingModels();
      serverStatus.servletContainer = context.getServerInfo();
      // Runtime manager is a container for settings and other parameters
      IRuntimeManager runtime = startManager(injector, IRuntimeManager.class);
      runtime.setBaseFolder(baseFolder);
      runtime.getStatus().isGO = goSettings != null;
      runtime.getStatus().servletContainer = context.getServerInfo();
      startManager(injector, INotificationManager.class);
      startManager(injector, IUserManager.class);
      startManager(injector, ISessionManager.class);
      repositoriesFolder = getRepositoriesFolder();
      logger.info("Gitblit base folder     = " + baseFolder.getAbsolutePath());
      logger.info("Git repositories folder = " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
      // prepare service executors
      luceneExecutor = new LuceneExecutor(runtimeSettings, getManager(IRepositoryManager.class));
      gcExecutor = new GCExecutor(runtimeSettings, getManager(IRepositoryManager.class));
      mirrorExecutor = new MirrorExecutor(runtimeSettings, getManager(IRepositoryManager.class));
      // initialize utilities
      String prefix = runtimeSettings.getString(Keys.git.userRepositoryPrefix, "~");
      ModelUtils.setUserRepoPrefix(prefix);
      // calculate repository list settings checksum for future config changes
      repositoryListSettingsChecksum.set(getRepositoryListSettingsChecksum());
      // build initial repository list
      if (runtimeSettings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Identifying available repositories...");
         getRepositoryList();
      }
      loadSettingModels(runtime.getSettingsModel());
      // load and cache the project metadata
      projectConfigs = new FileBasedConfig(runtime.getFileOrFolder(Keys.web.projectsFile, "${baseFolder}/projects.conf"), FS.detect());
      getProjectConfigs();
      configureLuceneIndexing();
      configureGarbageCollector();
      configureMirrorExecutor();
      if (true/*startFederation*/) {
         configureFederation();
      }
      configureJGit();
      configureFanout();
      configureGitDaemon();
      configureCommitCache();
   }
   /**
    * Configures Gitblit GO
    *
    * @param context
    * @param settings
    * @param baseFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   protected File configureGO(
         ServletContext context,
         IStoredSettings goSettings,
         File goBaseFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(goSettings);
      File base = goBaseFolder;
      return base;
   }
   /**
    * Configures a standard WAR instance of Gitblit.
    *
    * @param context
    * @param webxmlSettings
    * @param contextFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   protected File configureWAR(
         ServletContext context,
         WebXmlSettings webxmlSettings,
         File contextFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // Gitblit is running in a standard servlet container
      logger.info("WAR contextFolder is " + ((contextFolder != null) ? contextFolder.getAbsolutePath() : "<empty>"));
      String path = webxmlSettings.getString(Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$ + "/WEB-INF/data");
      if (path.contains(Constants.contextFolder$) && contextFolder == null) {
         // warn about null contextFolder (issue-199)
         logger.error("");
         logger.error(MessageFormat.format("\"{0}\" depends on \"{1}\" but \"{2}\" is returning NULL for \"{1}\"!",
               Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$, context.getServerInfo()));
         logger.error(MessageFormat.format("Please specify a non-parameterized path for <context-param> {0} in web.xml!!", Constants.baseFolder));
         logger.error(MessageFormat.format("OR configure your servlet container to specify a \"{0}\" parameter in the context configuration!!", Constants.baseFolder));
         logger.error("");
      }
      try {
         // try to lookup JNDI env-entry for the baseFolder
         InitialContext ic = new InitialContext();
         Context env = (Context) ic.lookup("java:comp/env");
         String val = (String) env.lookup("baseFolder");
         if (!StringUtils.isEmpty(val)) {
            path = val;
         }
      } catch (NamingException n) {
         logger.error("Failed to get JNDI env-entry: " + n.getExplanation());
      }
      File base = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.contextFolder$, contextFolder, path);
      base.mkdirs();
      // try to extract the data folder resource to the baseFolder
      File localSettings = new File(base, "gitblit.properties");
      if (!localSettings.exists()) {
         extractResources(context, "/WEB-INF/data/", base);
      }
      // delegate all config to baseFolder/gitblit.properties file
      FileSettings fileSettings = new FileSettings(localSettings.getAbsolutePath());
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(fileSettings);
      return base;
   }
   /**
    * Configures an OpenShift instance of Gitblit.
    *
    * @param context
    * @param webxmlSettings
    * @param contextFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   private File configureExpress(
         ServletContext context,
         WebXmlSettings webxmlSettings,
         File contextFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // Gitblit is running in OpenShift/JBoss
      String openShift = System.getenv("OPENSHIFT_DATA_DIR");
      File base = new File(openShift);
      logger.info("EXPRESS contextFolder is " + contextFolder.getAbsolutePath());
      // Copy the included scripts to the configured groovy folder
      String path = webxmlSettings.getString(Keys.groovy.scriptsFolder, "groovy");
      File localScripts = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.baseFolder$, base, path);
      if (!localScripts.exists()) {
         File warScripts = new File(contextFolder, "/WEB-INF/data/groovy");
         if (!warScripts.equals(localScripts)) {
            try {
               com.gitblit.utils.FileUtils.copy(localScripts, warScripts.listFiles());
            } catch (IOException e) {
               logger.error(MessageFormat.format(
                     "Failed to copy included Groovy scripts from {0} to {1}",
                     warScripts, localScripts));
            }
         }
      }
      // merge the WebXmlSettings into the runtime settings (for backwards-compatibilty)
      runtimeSettings.merge(webxmlSettings);
      // settings are to be stored in openshift/gitblit.properties
      File localSettings = new File(base, "gitblit.properties");
      FileSettings fileSettings = new FileSettings(localSettings.getAbsolutePath());
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(fileSettings);
      return base;
   }
   protected void extractResources(ServletContext context, String path, File toDir) {
@@ -3856,6 +3209,11 @@
   @Override
   protected void destroyContext(ServletContext context) {
      logger.info("Gitblit context destroyed by servlet container.");
      for (IManager manager : managers) {
         logger.debug("stopping {}", manager.getClass().getSimpleName());
         manager.stop();
      }
      scheduledExecutor.shutdownNow();
      luceneExecutor.close();
      gcExecutor.close();
@@ -3919,7 +3277,7 @@
      // add the owner of the source repository to the clone's access list
      if (!ArrayUtils.isEmpty(repository.owners)) {
         for (String owner : repository.owners) {
            UserModel originOwner = getUserModel(owner);
            UserModel originOwner = getManager(IUserManager.class).getUserModel(owner);
            if (originOwner != null) {
               originOwner.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
               updateUserModel(originOwner.username, originOwner, false);
@@ -3932,7 +3290,7 @@
      List<UserModel> cloneUsers = new ArrayList<UserModel>();
      for (String name : users) {
         if (!name.equalsIgnoreCase(user.username)) {
            UserModel cloneUser = getUserModel(name);
            UserModel cloneUser = getManager(IUserManager.class).getUserModel(name);
            if (cloneUser.canClone(repository)) {
               // origin user can clone origin, grant clone access to fork
               cloneUser.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
@@ -3940,123 +3298,39 @@
            cloneUsers.add(cloneUser);
         }
      }
      userService.updateUserModels(cloneUsers);
      getManager(IUserManager.class).updateUserModels(cloneUsers);
      // grant origin's team list clone permission to fork
      List<String> teams = getRepositoryTeams(repository);
      List<TeamModel> cloneTeams = new ArrayList<TeamModel>();
      for (String name : teams) {
         TeamModel cloneTeam = getTeamModel(name);
         TeamModel cloneTeam = getManager(IUserManager.class).getTeamModel(name);
         if (cloneTeam.canClone(repository)) {
            // origin team can clone origin, grant clone access to fork
            cloneTeam.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
         }
         cloneTeams.add(cloneTeam);
      }
      userService.updateTeamModels(cloneTeams);
      getManager(IUserManager.class).updateTeamModels(cloneTeams);
      // add this clone to the cached model
      addToCachedRepositoryList(cloneModel);
      return cloneModel;
   }
   /**
    * Allow to understand if GitBlit supports and is configured to allow
    * cookie-based authentication.
    *
    * @return status of Cookie authentication enablement.
    */
   @Override
   public boolean supportsCookies() {
      return settings.getBoolean(Keys.web.allowCookieAuthentication, true) && userService.supportsCookies();
   }
   @Override
   public String getCookie(UserModel model) {
      return userService.getCookie(model);
   }
   @Override
   public UserModel authenticate(char[] cookie) {
      return userService.authenticate(cookie);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModel(UserModel model) {
      return userService.updateUserModel(model);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModels(Collection<UserModel> models) {
      return userService.updateUserModels(models);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModel(String username, UserModel model) {
      return userService.updateUserModel(username, model);
   }
   @Override
   public boolean deleteUserModel(UserModel model) {
      return userService.deleteUserModel(model);
   }
   @Override
   public List<String> getAllTeamNames() {
      return userService.getAllTeamNames();
   }
   @Override
   public List<String> getTeamnamesForRepositoryRole(String role) {
      return userService.getTeamnamesForRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModel(TeamModel model) {
      return userService.updateTeamModel(model);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModels(Collection<TeamModel> models) {
      return userService.updateTeamModels(models);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModel(String teamname, TeamModel model) {
      return userService.updateTeamModel(teamname, model);
   }
   @Override
   public boolean deleteTeamModel(TeamModel model) {
      return userService.deleteTeamModel(model);
   }
   @Override
   public List<String> getUsernamesForRepositoryRole(String role) {
      return userService.getUsernamesForRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public boolean renameRepositoryRole(String oldRole, String newRole) {
      return userService.renameRepositoryRole(oldRole, newRole);
   }
   @Override
   public boolean deleteRepositoryRole(String role) {
      return userService.deleteRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public void logout(HttpServletResponse response, UserModel user) {
      setCookie(response,  null);
      userService.logout(user);
   }
   @Override
   protected Object [] getModules() {
      return new Object [] { new DaggerModule(this) };
   }
   protected <X extends IManager> X startManager(ObjectGraph injector, Class<X> clazz) {
      logger.debug("injecting and starting {}", clazz.getSimpleName());
      X x = injector.get(clazz);
      x.setup();
      managers.add(x);
      return x;
   }
   /**
    * Instantiate and inject all filters and servlets into the container using
    * the servlet 3 specification.