James Moger
2012-09-29 1e1b85270f93b3bca624c99b478f3a9a23be2395
src/com/gitblit/GitBlit.java
@@ -22,6 +22,8 @@
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;
import java.lang.reflect.Field;
import java.net.URI;
import java.net.URISyntaxException;
import java.text.MessageFormat;
import java.text.SimpleDateFormat;
import java.util.ArrayList;
@@ -37,12 +39,14 @@
import java.util.Map.Entry;
import java.util.Set;
import java.util.TimeZone;
import java.util.TreeMap;
import java.util.TreeSet;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
import java.util.concurrent.Executors;
import java.util.concurrent.ScheduledExecutorService;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicInteger;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicReference;
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
@@ -56,6 +60,10 @@
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache.FileKey;
import org.eclipse.jgit.lib.StoredConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.FileBasedConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCache;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCacheConfig;
import org.eclipse.jgit.transport.ServiceMayNotContinueException;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.FileResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.RepositoryResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.ServiceNotAuthorizedException;
@@ -66,6 +74,7 @@
import org.slf4j.LoggerFactory;
import com.gitblit.Constants.AccessRestrictionType;
import com.gitblit.Constants.AuthorizationControl;
import com.gitblit.Constants.FederationRequest;
import com.gitblit.Constants.FederationStrategy;
import com.gitblit.Constants.FederationToken;
@@ -73,6 +82,7 @@
import com.gitblit.models.FederationProposal;
import com.gitblit.models.FederationSet;
import com.gitblit.models.Metric;
import com.gitblit.models.ProjectModel;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.models.ServerSettings;
@@ -82,6 +92,8 @@
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.ByteFormat;
import com.gitblit.utils.ContainerUtils;
import com.gitblit.utils.DeepCopier;
import com.gitblit.utils.FederationUtils;
import com.gitblit.utils.JGitUtils;
import com.gitblit.utils.JsonUtils;
@@ -121,6 +133,12 @@
   private final ObjectCache<Long> repositorySizeCache = new ObjectCache<Long>();
   private final ObjectCache<List<Metric>> repositoryMetricsCache = new ObjectCache<List<Metric>>();
   private final Map<String, RepositoryModel> repositoryListCache = new ConcurrentHashMap<String, RepositoryModel>();
   private final Map<String, ProjectModel> projectCache = new ConcurrentHashMap<String, ProjectModel>();
   private final AtomicReference<String> repositoryListSettingsChecksum = new AtomicReference<String>("");
   private RepositoryResolver<Void> repositoryResolver;
@@ -141,6 +159,8 @@
   private LuceneExecutor luceneExecutor;
   
   private TimeZone timezone;
   private FileBasedConfig projectConfigs;
   public GitBlit() {
      if (gitblit == null) {
@@ -185,6 +205,15 @@
         self().timezone = TimeZone.getTimeZone(tzid);
      }
      return self().timezone;
   }
   /**
    * Returns the user-defined blob encodings.
    *
    * @return an array of encodings, may be empty
    */
   public static String [] getEncodings() {
      return getStrings(Keys.web.blobEncodings).toArray(new String[0]);
   }
   
@@ -501,9 +530,15 @@
            userCookie = new Cookie(Constants.NAME, "");
         } else {
            // set cookie for login
            char[] cookie = userService.getCookie(user);
            userCookie = new Cookie(Constants.NAME, new String(cookie));
            userCookie.setMaxAge(Integer.MAX_VALUE);
            String cookie = userService.getCookie(user);
            if (StringUtils.isEmpty(cookie)) {
               // create empty cookie
               userCookie = new Cookie(Constants.NAME, "");
            } else {
               // create real cookie
               userCookie = new Cookie(Constants.NAME, cookie);
               userCookie.setMaxAge(Integer.MAX_VALUE);
            }
         }
         userCookie.setPath("/");
         response.addCookie(userCookie);
@@ -704,15 +739,89 @@
   public boolean deleteTeam(String teamname) {
      return userService.deleteTeam(teamname);
   }
   /**
    * Adds the repository to the list of cached repositories if Gitblit is
    * configured to cache the repository list.
    *
    * @param name
    */
   private void addToCachedRepositoryList(String name, RepositoryModel model) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         repositoryListCache.put(name, model);
         // update the fork origin repository with this repository clone
         if (!StringUtils.isEmpty(model.originRepository)) {
            if (repositoryListCache.containsKey(model.originRepository)) {
               RepositoryModel origin = repositoryListCache.get(model.originRepository);
               origin.addFork(name);
            }
         }
      }
   }
   /**
    * Removes the repository from the list of cached repositories.
    *
    * @param name
    * @return the model being removed
    */
   private RepositoryModel removeFromCachedRepositoryList(String name) {
      if (StringUtils.isEmpty(name)) {
         return null;
      }
      return repositoryListCache.remove(name);
   }
   /**
    * Clears all the cached data for the specified repository.
    * Clears all the cached metadata for the specified repository.
    * 
    * @param repositoryName
    */
   public void clearRepositoryCache(String repositoryName) {
   private void clearRepositoryMetadataCache(String repositoryName) {
      repositorySizeCache.remove(repositoryName);
      repositoryMetricsCache.remove(repositoryName);
   }
   /**
    * Resets the repository list cache.
    *
    */
   public void resetRepositoryListCache() {
      logger.info("Repository cache manually reset");
      repositoryListCache.clear();
   }
   /**
    * Calculate the checksum of settings that affect the repository list cache.
    * @return a checksum
    */
   private String getRepositoryListSettingsChecksum() {
      StringBuilder ns = new StringBuilder();
      ns.append(settings.getString(Keys.git.cacheRepositoryList, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRecursionDepth, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchExclusions, "")).append('\n');
      String checksum = StringUtils.getSHA1(ns.toString());
      return checksum;
   }
   /**
    * Compare the last repository list setting checksum to the current checksum.
    * If different then clear the cache so that it may be rebuilt.
    *
    * @return true if the cached repository list is valid since the last check
    */
   private boolean isValidRepositoryList() {
      String newChecksum = getRepositoryListSettingsChecksum();
      boolean valid = newChecksum.equals(repositoryListSettingsChecksum.get());
      repositoryListSettingsChecksum.set(newChecksum);
      if (!valid && settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Repository list settings have changed. Clearing repository list cache.");
         repositoryListCache.clear();
      }
      return valid;
   }
   /**
@@ -722,9 +831,48 @@
    * @return list of all repositories
    */
   public List<String> getRepositoryList() {
      return JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
            settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
            settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true));
      if (repositoryListCache.size() == 0 || !isValidRepositoryList()) {
         // we are not caching OR we have not yet cached OR the cached list is invalid
         long startTime = System.currentTimeMillis();
         List<String> repositories = JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
               settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
               settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true),
               settings.getInteger(Keys.git.searchRecursionDepth, -1),
               settings.getStrings(Keys.git.searchExclusions));
         if (!settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
            // we are not caching
            StringUtils.sortRepositorynames(repositories);
            return repositories;
         } else {
            // we are caching this list
            String msg = "{0} repositories identified in {1} msecs";
            // optionally (re)calculate repository sizes
            if (getBoolean(Keys.web.showRepositorySizes, true)) {
               msg = "{0} repositories identified with calculated folder sizes in {1} msecs";
               for (String repository : repositories) {
                  RepositoryModel model = getRepositoryModel(repository);
                  if (!model.skipSizeCalculation) {
                     calculateSize(model);
                  }
               }
            } else {
               // update cache
               for (String repository : repositories) {
                  getRepositoryModel(repository);
               }
            }
            long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
            logger.info(MessageFormat.format(msg, repositoryListCache.size(), duration));
         }
      }
      // return sorted copy of cached list
      List<String> list = new ArrayList<String>(repositoryListCache.keySet());
      StringUtils.sortRepositorynames(list);
      return list;
   }
   /**
@@ -766,6 +914,12 @@
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
         }
      } catch (ServiceMayNotContinueException e) {
         r = null;
         if (logError) {
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
         }
      }
      return r;
   }
@@ -777,6 +931,7 @@
    * @return list of repository models accessible to user
    */
   public List<RepositoryModel> getRepositoryModels(UserModel user) {
      long methodStart = System.currentTimeMillis();
      List<String> list = getRepositoryList();
      List<RepositoryModel> repositories = new ArrayList<RepositoryModel>();
      for (String repo : list) {
@@ -796,9 +951,15 @@
            }
         }
         long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
         logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
         if (duration > 250) {
            // only log calcualtion time if > 250 msecs
            logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
               repoCount, duration));
         }
      }
      long duration = System.currentTimeMillis() - methodStart;
      logger.info(MessageFormat.format("{0} repository models loaded for {1} in {2} msecs",
            repositories.size(), user == null ? "anonymous" : user.username, duration));
      return repositories;
   }
@@ -833,6 +994,241 @@
    * @return repository model or null
    */
   public RepositoryModel getRepositoryModel(String repositoryName) {
      if (!repositoryListCache.containsKey(repositoryName)) {
         RepositoryModel model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         if (model == null) {
            return null;
         }
         addToCachedRepositoryList(repositoryName, model);
         return model;
      }
      // cached model
      RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repositoryName);
      // check for updates
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         // repository is missing
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         logger.error(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" is missing! Removing from cache.", repositoryName));
         return null;
      }
      FileBasedConfig config = (FileBasedConfig) getRepositoryConfig(r);
      if (config.isOutdated()) {
         // reload model
         logger.info(MessageFormat.format("Config for \"{0}\" has changed. Reloading model and updating cache.", repositoryName));
         model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         addToCachedRepositoryList(repositoryName, model);
      } else {
         // update a few repository parameters
         if (!model.hasCommits) {
            // update hasCommits, assume a repository only gains commits :)
            model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
         }
         model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      }
      r.close();
      // return a copy of the cached model
      return DeepCopier.copy(model);
   }
   /**
    * Returns the map of project config.  This map is cached and reloaded if
    * the underlying projects.conf file changes.
    *
    * @return project config map
    */
   private Map<String, ProjectModel> getProjectConfigs() {
      if (projectCache.isEmpty() || projectConfigs.isOutdated()) {
         try {
            projectConfigs.load();
         } catch (Exception e) {
         }
         // project configs
         String rootName = GitBlit.getString(Keys.web.repositoryRootGroupName, "main");
         ProjectModel rootProject = new ProjectModel(rootName, true);
         Map<String, ProjectModel> configs = new HashMap<String, ProjectModel>();
         // cache the root project under its alias and an empty path
         configs.put("", rootProject);
         configs.put(rootProject.name.toLowerCase(), rootProject);
         for (String name : projectConfigs.getSubsections("project")) {
            ProjectModel project;
            if (name.equalsIgnoreCase(rootName)) {
               project = rootProject;
            } else {
               project = new ProjectModel(name);
            }
            project.title = projectConfigs.getString("project", name, "title");
            project.description = projectConfigs.getString("project", name, "description");
            // TODO add more interesting metadata
            // project manager?
            // commit message regex?
            // RW+
            // RW
            // R
            configs.put(name.toLowerCase(), project);
         }
         projectCache.clear();
         projectCache.putAll(configs);
      }
      return projectCache;
   }
   /**
    * Returns a list of project models for the user.
    *
    * @param user
    * @param includeUsers
    * @return list of projects that are accessible to the user
    */
   public List<ProjectModel> getProjectModels(UserModel user, boolean includeUsers) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      // per-user project lists, this accounts for security and visibility
      Map<String, ProjectModel> map = new TreeMap<String, ProjectModel>();
      // root project
      map.put("", configs.get(""));
      for (RepositoryModel model : getRepositoryModels(user)) {
         String rootPath = StringUtils.getRootPath(model.name).toLowerCase();
         if (!map.containsKey(rootPath)) {
            ProjectModel project;
            if (configs.containsKey(rootPath)) {
               // clone the project model because it's repository list will
               // be tailored for the requesting user
               project = DeepCopier.copy(configs.get(rootPath));
            } else {
               project = new ProjectModel(rootPath);
            }
            map.put(rootPath, project);
         }
         map.get(rootPath).addRepository(model);
      }
      // sort projects, root project first
      List<ProjectModel> projects;
      if (includeUsers) {
         // all projects
         projects = new ArrayList<ProjectModel>(map.values());
         Collections.sort(projects);
         projects.remove(map.get(""));
         projects.add(0, map.get(""));
      } else {
         // all non-user projects
         projects = new ArrayList<ProjectModel>();
         ProjectModel root = map.remove("");
         for (ProjectModel model : map.values()) {
            if (!model.isUserProject()) {
               projects.add(model);
            }
         }
         Collections.sort(projects);
         projects.add(0, root);
      }
      return projects;
   }
   /**
    * Returns the project model for the specified user.
    *
    * @param name
    * @param user
    * @return a project model, or null if it does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name, UserModel user) {
      for (ProjectModel project : getProjectModels(user, true)) {
         if (project.name.equalsIgnoreCase(name)) {
            return project;
         }
      }
      return null;
   }
   /**
    * Returns a project model for the Gitblit/system user.
    *
    * @param name a project name
    * @return a project model or null if the project does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      ProjectModel project = configs.get(name.toLowerCase());
      if (project == null) {
         project = new ProjectModel(name);
         if (name.length() > 0 && name.charAt(0) == '~') {
            UserModel user = getUserModel(name.substring(1));
            if (user != null) {
               project.title = user.getDisplayName();
               project.description = "personal repositories";
            }
         }
      } else {
         // clone the object
         project = DeepCopier.copy(project);
      }
      if (StringUtils.isEmpty(name)) {
         // get root repositories
         for (String repository : getRepositoryList()) {
            if (repository.indexOf('/') == -1) {
               project.addRepository(repository);
            }
         }
      } else {
         // get repositories in subfolder
         String folder = name.toLowerCase() + "/";
         for (String repository : getRepositoryList()) {
            if (repository.toLowerCase().startsWith(folder)) {
               project.addRepository(repository);
            }
         }
      }
      if (project.repositories.size() == 0) {
         // no repositories == no project
         return null;
      }
      return project;
   }
   /**
    * Workaround JGit.  I need to access the raw config object directly in order
    * to see if the config is dirty so that I can reload a repository model.
    * If I use the stock JGit method to get the config it already reloads the
    * config.  If the config changes are made within Gitblit this is fine as
    * the returned config will still be flagged as dirty.  BUT... if the config
    * is manipulated outside Gitblit then it fails to recognize this as dirty.
    *
    * @param r
    * @return a config
    */
   private StoredConfig getRepositoryConfig(Repository r) {
      try {
         Field f = r.getClass().getDeclaredField("repoConfig");
         f.setAccessible(true);
         StoredConfig config = (StoredConfig) f.get(r);
         return config;
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to retrieve \"repoConfig\" via reflection", e);
      }
      return r.getConfig();
   }
   /**
    * Create a repository model from the configuration and repository data.
    *
    * @param repositoryName
    * @return a repositoryModel or null if the repository does not exist
    */
   private RepositoryModel loadRepositoryModel(String repositoryName) {
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         return null;
@@ -842,15 +1238,26 @@
      model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
      model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      model.isBare = r.isBare();
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      if (repositoryName.indexOf('/') == -1) {
         model.projectPath = "";
      } else {
         model.projectPath = repositoryName.substring(0, repositoryName.indexOf('/'));
      }
      StoredConfig config = r.getConfig();
      boolean hasOrigin = !StringUtils.isEmpty(config.getString("remote", "origin", "url"));
      if (config != null) {
         model.description = getConfig(config, "description", "");
         model.owner = getConfig(config, "owner", "");
         model.useTickets = getConfig(config, "useTickets", false);
         model.useDocs = getConfig(config, "useDocs", false);
         model.allowForks = getConfig(config, "allowForks", true);
         model.accessRestriction = AccessRestrictionType.fromName(getConfig(config,
               "accessRestriction", settings.getString(Keys.git.defaultAccessRestriction, null)));
         model.showRemoteBranches = getConfig(config, "showRemoteBranches", false);
         model.authorizationControl = AuthorizationControl.fromName(getConfig(config,
               "authorizationControl", settings.getString(Keys.git.defaultAuthorizationControl, null)));
         model.showRemoteBranches = getConfig(config, "showRemoteBranches", hasOrigin);
         model.isFrozen = getConfig(config, "isFrozen", false);
         model.showReadme = getConfig(config, "showReadme", false);
         model.skipSizeCalculation = getConfig(config, "skipSizeCalculation", false);
@@ -879,7 +1286,44 @@
      model.HEAD = JGitUtils.getHEADRef(r);
      model.availableRefs = JGitUtils.getAvailableHeadTargets(r);
      r.close();
      if (model.origin != null && model.origin.startsWith("file://")) {
         // repository was cloned locally... perhaps as a fork
         try {
            File folder = new File(new URI(model.origin));
            String originRepo = com.gitblit.utils.FileUtils.getRelativePath(getRepositoriesFolder(), folder);
            if (!StringUtils.isEmpty(originRepo)) {
               // ensure origin still exists
               File repoFolder = new File(getRepositoriesFolder(), originRepo);
               if (repoFolder.exists()) {
                  model.originRepository = originRepo;
               }
            }
         } catch (URISyntaxException e) {
            logger.error("Failed to determine fork for " + model, e);
         }
      }
      return model;
   }
   /**
    * Determines if this server has the requested repository.
    *
    * @param name
    * @return true if the repository exists
    */
   public boolean hasRepository(String repositoryName) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         // if we are caching use the cache to determine availability
         // otherwise we end up adding a phantom repository to the cache
         return repositoryListCache.containsKey(repositoryName);
      }
      Repository r = getRepository(repositoryName, false);
      if (r == null) {
         return false;
      }
      r.close();
      return true;
   }
   /**
@@ -1055,9 +1499,27 @@
                     "Failed to rename repository permissions ''{0}'' to ''{1}''.",
                     repositoryName, repository.name));
            }
            // rename fork origins in their configs
            if (!ArrayUtils.isEmpty(repository.forks)) {
               for (String fork : repository.forks) {
                  Repository rf = getRepository(fork);
                  try {
                     StoredConfig config = rf.getConfig();
                     String origin = config.getString("remote", "origin", "url");
                     origin = origin.replace(repositoryName, repository.name);
                     config.setString("remote", "origin", "url", origin);
                     config.save();
                  } catch (Exception e) {
                     logger.error("Failed to update repository fork config for " + fork, e);
                  }
                  rf.close();
               }
            }
            // clear the cache
            clearRepositoryCache(repositoryName);
            clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
            repository.resetDisplayName();
         }
         // load repository
@@ -1070,6 +1532,8 @@
            logger.error("Service not authorized", e);
         } catch (ServiceNotEnabledException e) {
            logger.error("Service not enabled", e);
         } catch (ServiceMayNotContinueException e) {
            logger.error("Service may not continue", e);
         }
      }
@@ -1083,15 +1547,20 @@
                  repository.name, currentRef, repository.HEAD));
            if (JGitUtils.setHEADtoRef(r, repository.HEAD)) {
               // clear the cache
               clearRepositoryCache(repository.name);
               clearRepositoryMetadataCache(repository.name);
            }
         }
         // close the repository object
         r.close();
      }
      // update repository cache
      removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
      // model will actually be replaced on next load because config is stale
      addToCachedRepositoryList(repository.name, repository);
   }
   /**
    * Updates the Gitblit configuration for the specified repository.
    * 
@@ -1101,12 +1570,14 @@
    *            the Gitblit repository model
    */
   public void updateConfiguration(Repository r, RepositoryModel repository) {
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      StoredConfig config = r.getConfig();
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "description", repository.description);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "owner", repository.owner);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "useTickets", repository.useTickets);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "useDocs", repository.useDocs);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "allowForks", repository.allowForks);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "accessRestriction", repository.accessRestriction.name());
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "authorizationControl", repository.authorizationControl.name());
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "showRemoteBranches", repository.showRemoteBranches);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "isFrozen", repository.isFrozen);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "showReadme", repository.showReadme);
@@ -1178,16 +1649,22 @@
   public boolean deleteRepository(String repositoryName) {
      try {
         closeRepository(repositoryName);
         // clear the repository cache
         clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
         RepositoryModel model = removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         if (!ArrayUtils.isEmpty(model.forks)) {
            resetRepositoryListCache();
         }
         File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
         if (folder.exists() && folder.isDirectory()) {
            FileUtils.delete(folder, FileUtils.RECURSIVE | FileUtils.RETRY);
            if (userService.deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
               logger.info(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" deleted", repositoryName));
               return true;
            }
         }
         // clear the repository cache
         clearRepositoryCache(repositoryName);
      } catch (Throwable t) {
         logger.error(MessageFormat.format("Failed to delete repository {0}", repositoryName), t);
      }
@@ -1812,9 +2289,13 @@
      // ensure that the current values are updated in the setting models
      for (String key : settings.getAllKeys(null)) {
         SettingModel setting = settingsModel.get(key);
         if (setting != null) {
            setting.currentValue = settings.getString(key, "");
         if (setting == null) {
            // unreferenced setting, create a setting model
            setting = new SettingModel();
            setting.name = key;
            settingsModel.add(setting);
         }
         setting.currentValue = settings.getString(key, "");
      }
      settingsModel.pushScripts = getAllScripts();
      return settingsModel;
@@ -1902,6 +2383,15 @@
      repositoriesFolder = getRepositoriesFolder();
      logger.info("Git repositories folder " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
      repositoryResolver = new FileResolver<Void>(repositoriesFolder, true);
      // calculate repository list settings checksum for future config changes
      repositoryListSettingsChecksum.set(getRepositoryListSettingsChecksum());
      // build initial repository list
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Identifying available repositories...");
         getRepositoryList();
      }
      
      logTimezone("JVM", TimeZone.getDefault());
      logTimezone(Constants.NAME, getTimezone());
@@ -1917,6 +2407,11 @@
         loginService = new GitblitUserService();
      }
      setUserService(loginService);
      // load and cache the project metadata
      projectConfigs = new FileBasedConfig(getFileOrFolder(Keys.web.projectsFile, "projects.conf"), FS.detect());
      getProjectConfigs();
      mailExecutor = new MailExecutor(settings);
      if (mailExecutor.isReady()) {
         logger.info("Mail executor is scheduled to process the message queue every 2 minutes.");
@@ -1929,7 +2424,31 @@
      scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(luceneExecutor, 1, 2, TimeUnit.MINUTES);
      if (startFederation) {
         configureFederation();
      }
      }
      // Configure JGit
      WindowCacheConfig cfg = new WindowCacheConfig();
      cfg.setPackedGitWindowSize(settings.getFilesize(Keys.git.packedGitWindowSize, cfg.getPackedGitWindowSize()));
      cfg.setPackedGitLimit(settings.getFilesize(Keys.git.packedGitLimit, cfg.getPackedGitLimit()));
      cfg.setDeltaBaseCacheLimit(settings.getFilesize(Keys.git.deltaBaseCacheLimit, cfg.getDeltaBaseCacheLimit()));
      cfg.setPackedGitOpenFiles(settings.getFilesize(Keys.git.packedGitOpenFiles, cfg.getPackedGitOpenFiles()));
      cfg.setStreamFileThreshold(settings.getFilesize(Keys.git.streamFileThreshold, cfg.getStreamFileThreshold()));
      cfg.setPackedGitMMAP(settings.getBoolean(Keys.git.packedGitMmap, cfg.isPackedGitMMAP()));
      try {
         WindowCache.reconfigure(cfg);
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1,number,0}", Keys.git.packedGitWindowSize, cfg.getPackedGitWindowSize()));
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1,number,0}", Keys.git.packedGitLimit, cfg.getPackedGitLimit()));
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1,number,0}", Keys.git.deltaBaseCacheLimit, cfg.getDeltaBaseCacheLimit()));
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1,number,0}", Keys.git.packedGitOpenFiles, cfg.getPackedGitOpenFiles()));
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1,number,0}", Keys.git.streamFileThreshold, cfg.getStreamFileThreshold()));
         logger.debug(MessageFormat.format("{0} = {1}", Keys.git.packedGitMmap, cfg.isPackedGitMMAP()));
      } catch (IllegalArgumentException e) {
         logger.error("Failed to configure JGit parameters!", e);
      }
      ContainerUtils.CVE_2007_0450.test();
   }
   
   private void logTimezone(String type, TimeZone zone) {
@@ -2001,4 +2520,52 @@
      scheduledExecutor.shutdownNow();
      luceneExecutor.close();
   }
   /**
    * Creates a personal fork of the specified repository. The clone is view
    * restricted by default and the owner of the source repository is given
    * access to the clone.
    *
    * @param repository
    * @param user
    * @return true, if successful
    */
   public boolean fork(RepositoryModel repository, UserModel user) {
      String cloneName = MessageFormat.format("~{0}/{1}.git", user.username, StringUtils.stripDotGit(StringUtils.getLastPathElement(repository.name)));
      String fromUrl = MessageFormat.format("file://{0}/{1}", repositoriesFolder.getAbsolutePath(), repository.name);
      try {
         // clone the repository
         JGitUtils.cloneRepository(repositoriesFolder, cloneName, fromUrl, true, null);
         // create a Gitblit repository model for the clone
         RepositoryModel cloneModel = repository.cloneAs(cloneName);
         cloneModel.owner = user.username;
         updateRepositoryModel(cloneName, cloneModel, false);
         if (AuthorizationControl.NAMED.equals(cloneModel.authorizationControl)) {
            // add the owner of the source repository to the clone's access list
            if (!StringUtils.isEmpty(repository.owner)) {
               UserModel owner = getUserModel(repository.owner);
               if (owner != null) {
                  owner.repositories.add(cloneName);
                  updateUserModel(owner.username, owner, false);
               }
            }
            // inherit origin's access lists
            List<String> users = getRepositoryUsers(repository);
            setRepositoryUsers(cloneModel, users);
            List<String> teams = getRepositoryTeams(repository);
            setRepositoryTeams(cloneModel, teams);
         }
         // add this clone to the cached model
         addToCachedRepositoryList(cloneModel.name, cloneModel);
         return true;
      } catch (Exception e) {
         logger.error("failed to fork", e);
      }
      return false;
   }
}