James Moger
2013-11-24 04a98505a4ab8f48aee22800fcac193d9367d0ae
src/main/java/com/gitblit/GitBlit.java
@@ -1,5 +1,5 @@
/*
 * Copyright 2011 gitblit.com.
 * Copyright 2013 gitblit.com.
 *
 * Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License");
 * you may not use this file except in compliance with the License.
@@ -15,1320 +15,740 @@
 */
package com.gitblit;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileFilter;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;
import java.io.OutputStream;
import java.lang.reflect.Type;
import java.text.MessageFormat;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collection;
import java.util.Collections;
import java.util.Date;
import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.util.Map;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
import java.util.concurrent.Executors;
import java.util.concurrent.ScheduledExecutorService;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
import java.util.TimeZone;
import javax.naming.Context;
import javax.naming.InitialContext;
import javax.naming.NamingException;
import javax.servlet.ServletContext;
import javax.servlet.annotation.WebListener;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
import org.apache.wicket.resource.ContextRelativeResource;
import org.apache.wicket.util.resource.ResourceStreamNotFoundException;
import org.slf4j.Logger;
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import com.gitblit.Constants.AccessPermission;
import com.gitblit.Constants.AccessRestrictionType;
import com.gitblit.Constants.FederationRequest;
import com.gitblit.Constants.FederationToken;
import com.gitblit.dagger.DaggerContextListener;
import com.gitblit.fanout.FanoutNioService;
import com.gitblit.fanout.FanoutService;
import com.gitblit.fanout.FanoutSocketService;
import com.gitblit.git.GitDaemon;
import com.gitblit.git.GitServlet;
import com.gitblit.manager.IAuthenticationManager;
import com.gitblit.manager.IFederationManager;
import com.gitblit.manager.IGitblitManager;
import com.gitblit.manager.IManager;
import com.gitblit.manager.INotificationManager;
import com.gitblit.manager.IProjectManager;
import com.gitblit.manager.IRepositoryManager;
import com.gitblit.manager.IRuntimeManager;
import com.gitblit.manager.ISessionManager;
import com.gitblit.manager.IUserManager;
import com.gitblit.models.FederationModel;
import com.gitblit.models.FederationProposal;
import com.gitblit.models.FederationSet;
import com.gitblit.models.ForkModel;
import com.gitblit.models.GitClientApplication;
import com.gitblit.models.Metric;
import com.gitblit.models.ProjectModel;
import com.gitblit.models.RegistrantAccessPermission;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.RepositoryUrl;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.models.ServerSettings;
import com.gitblit.models.SettingModel;
import com.gitblit.models.ServerStatus;
import com.gitblit.models.TeamModel;
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.ContainerUtils;
import com.gitblit.utils.FederationUtils;
import com.gitblit.utils.HttpUtils;
import com.gitblit.utils.JGitUtils;
import com.gitblit.utils.JsonUtils;
import com.gitblit.utils.ObjectCache;
import com.gitblit.utils.StringUtils;
import com.gitblit.wicket.GitblitWicketFilter;
import com.gitblit.wicket.WicketUtils;
import com.google.gson.Gson;
import com.google.gson.JsonIOException;
import com.google.gson.JsonSyntaxException;
import com.google.gson.reflect.TypeToken;
import dagger.ObjectGraph;
/**
 * GitBlit is the servlet context listener singleton that acts as the core for
 * the web ui and the servlets. This class is either directly instantiated by
 * the GitBlitServer class (Gitblit GO) or is reflectively instantiated by the
 * servlet 3 container (Gitblit WAR or Express).
 *
 * This class is the central logic processor for Gitblit. All settings, user
 * object, and repository object operations pass through this class.
 * GitBlit is an aggregate interface delegate.  It implements all the manager
 * interfaces and delegates all methods calls to the actual manager implementations.
 * It's primary purpose is to provide complete management control to the git
 * upload and receive pack functions.
 *
 * @author James Moger
 *
 */
@WebListener
public class GitBlit extends DaggerContextListener
                implements IFederationManager,
                        IGitblitManager {
public class GitBlit implements IRuntimeManager,
                        INotificationManager,
                        IUserManager,
                        IAuthenticationManager,
                        IRepositoryManager,
                        IProjectManager,
                        IGitblitManager,
                        IFederationManager {
   private static GitBlit gitblit;
   private final IRuntimeManager runtimeManager;
   private final IStoredSettings goSettings;
   private final INotificationManager notificationManager;
   private final File goBaseFolder;
   private final IUserManager userManager;
   private final List<IManager> managers = new ArrayList<IManager>();
   private final IAuthenticationManager authenticationManager;
   private final ScheduledExecutorService scheduledExecutor = Executors.newScheduledThreadPool(10);
   private final IRepositoryManager repositoryManager;
   private final List<FederationModel> federationRegistrations = Collections
         .synchronizedList(new ArrayList<FederationModel>());
   private final IProjectManager projectManager;
   private final ObjectCache<Collection<GitClientApplication>> clientApplications = new ObjectCache<Collection<GitClientApplication>>();
   private final IGitblitManager gitblitManager;
   private final Map<String, FederationModel> federationPullResults = new ConcurrentHashMap<String, FederationModel>();
   private final IFederationManager federationManager;
   private IStoredSettings settings;
   public GitBlit(
         IRuntimeManager runtimeManager,
         INotificationManager notificationManager,
         IUserManager userManager,
         IAuthenticationManager authenticationManager,
         IRepositoryManager repositoryManager,
         IProjectManager projectManager,
         IGitblitManager gitblitManager,
         IFederationManager federationManager) {
   private FanoutService fanoutService;
   private GitDaemon gitDaemon;
   public GitBlit() {
      this.goSettings = null;
      this.goBaseFolder = null;
      this.runtimeManager = runtimeManager;
      this.notificationManager = notificationManager;
      this.userManager = userManager;
      this.authenticationManager = authenticationManager;
      this.repositoryManager = repositoryManager;
      this.projectManager = projectManager;
      this.gitblitManager = gitblitManager;
      this.federationManager = federationManager;
   }
   public GitBlit(IStoredSettings settings, File baseFolder) {
      this.goSettings = settings;
      this.goBaseFolder = baseFolder;
      gitblit = this;
   @Override
   public GitBlit start() {
      return this;
   }
   /**
    * Returns the Gitblit singleton.
   @Override
   public GitBlit stop() {
      return this;
   }
   /*
    * ISTOREDSETTINGS
    *
    * @return gitblit singleton
    * these methods are necessary for (nearly) seamless Groovy hook operation
    * after the massive refactor.
    */
   public static GitBlit self() {
      return gitblit;
   public boolean getBoolean(String key, boolean defaultValue) {
      return runtimeManager.getSettings().getBoolean(key, defaultValue);
   }
   @SuppressWarnings("unchecked")
   public static <X> X getManager(Class<X> managerClass) {
      if (managerClass.isAssignableFrom(GitBlit.class)) {
         return (X) gitblit;
      }
      for (IManager manager : gitblit.managers) {
         if (managerClass.isAssignableFrom(manager.getClass())) {
            return (X) manager;
         }
      }
      return null;
   public String getString(String key, String defaultValue) {
      return runtimeManager.getSettings().getString(key, defaultValue);
   }
   /**
    * Returns the path of the proposals folder. This method checks to see if
    * Gitblit is running on a cloud service and may return an adjusted path.
    *
    * @return the proposals folder path
   public int getInteger(String key, int defaultValue) {
      return runtimeManager.getSettings().getInteger(key, defaultValue);
   }
   public List<String> getStrings(String key) {
      return runtimeManager.getSettings().getStrings(key);
   }
   /*
    * RUNTIME MANAGER
    */
   @Override
   public File getBaseFolder() {
      return runtimeManager.getBaseFolder();
   }
   @Override
   public void setBaseFolder(File folder) {
      runtimeManager.setBaseFolder(folder);
   }
   @Override
   public Date getBootDate() {
      return runtimeManager.getBootDate();
   }
   @Override
   public ServerSettings getSettingsModel() {
      return runtimeManager.getSettingsModel();
   }
   @Override
   public boolean isServingRepositories() {
      return runtimeManager.isServingRepositories();
   }
   @Override
   public TimeZone getTimezone() {
      return runtimeManager.getTimezone();
   }
   @Override
   public boolean isDebugMode() {
      return runtimeManager.isDebugMode();
   }
   @Override
   public File getFileOrFolder(String key, String defaultFileOrFolder) {
      return runtimeManager.getFileOrFolder(key, defaultFileOrFolder);
   }
   @Override
   public File getFileOrFolder(String fileOrFolder) {
      return runtimeManager.getFileOrFolder(fileOrFolder);
   }
   @Override
   public IStoredSettings getSettings() {
      return runtimeManager.getSettings();
   }
   @Override
   public boolean updateSettings(Map<String, String> updatedSettings) {
      return runtimeManager.updateSettings(updatedSettings);
   }
   @Override
   public ServerStatus getStatus() {
      return runtimeManager.getStatus();
   }
   /*
    * NOTIFICATION MANAGER
    */
   @Override
   public void sendMailToAdministrators(String subject, String message) {
      notificationManager.sendMailToAdministrators(subject, message);
   }
   @Override
   public void sendMail(String subject, String message, Collection<String> toAddresses) {
      notificationManager.sendMail(subject, message, toAddresses);
   }
   @Override
   public void sendMail(String subject, String message, String... toAddresses) {
      notificationManager.sendMail(subject, message, toAddresses);
   }
   @Override
   public void sendHtmlMail(String subject, String message, Collection<String> toAddresses) {
      notificationManager.sendHtmlMail(subject, message, toAddresses);
   }
   @Override
   public void sendHtmlMail(String subject, String message, String... toAddresses) {
      notificationManager.sendHtmlMail(subject, message, toAddresses);
   }
   /*
    * SESSION MANAGER
    */
   @Override
   public UserModel authenticate(String username, char[] password) {
      return authenticationManager.authenticate(username, password);
   }
   @Override
   public UserModel authenticate(HttpServletRequest httpRequest) {
      return authenticationManager.authenticate(httpRequest, false);
   }
   @Override
   public UserModel authenticate(HttpServletRequest httpRequest, boolean requiresCertificate) {
      return authenticationManager.authenticate(httpRequest, requiresCertificate);
   }
   @Override
   public void setCookie(HttpServletResponse response, UserModel user) {
      authenticationManager.setCookie(response, user);
   }
   @Override
   public void logout(HttpServletResponse response, UserModel user) {
      authenticationManager.logout(response, user);
   }
   @Override
   public boolean supportsCredentialChanges(UserModel user) {
      return authenticationManager.supportsCredentialChanges(user);
   }
   @Override
   public boolean supportsDisplayNameChanges(UserModel user) {
      return authenticationManager.supportsDisplayNameChanges(user);
   }
   @Override
   public boolean supportsEmailAddressChanges(UserModel user) {
      return authenticationManager.supportsEmailAddressChanges(user);
   }
   @Override
   public boolean supportsTeamMembershipChanges(UserModel user) {
      return authenticationManager.supportsTeamMembershipChanges(user);
   }
   @Override
   public boolean supportsTeamMembershipChanges(TeamModel team) {
      return authenticationManager.supportsTeamMembershipChanges(team);
   }
   /*
    * USER MANAGER
    */
   @Override
   public void setup(IRuntimeManager runtimeManager) {
   }
   @Override
   public List<String> getAllUsernames() {
      return userManager.getAllUsernames();
   }
   @Override
   public List<UserModel> getAllUsers() {
      return userManager.getAllUsers();
   }
   @Override
   public boolean deleteUser(String username) {
      return userManager.deleteUser(username);
   }
   @Override
   public UserModel getUserModel(String username) {
      return userManager.getUserModel(username);
   }
   @Override
   public List<TeamModel> getAllTeams() {
      return userManager.getAllTeams();
   }
   @Override
   public TeamModel getTeamModel(String teamname) {
      return userManager.getTeamModel(teamname);
   }
   @Override
   public String getCookie(UserModel model) {
      return userManager.getCookie(model);
   }
   @Override
   public UserModel getUserModel(char[] cookie) {
      return userManager.getUserModel(cookie);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModel(UserModel model) {
      return userManager.updateUserModel(model);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModels(Collection<UserModel> models) {
      return userManager.updateUserModels(models);
   }
   @Override
   public boolean updateUserModel(String username, UserModel model) {
      return userManager.updateUserModel(username, model);
   }
   @Override
   public boolean deleteUserModel(UserModel model) {
      return userManager.deleteUserModel(model);
   }
   @Override
   public List<String> getAllTeamNames() {
      return userManager.getAllTeamNames();
   }
   @Override
   public List<String> getTeamNamesForRepositoryRole(String role) {
      return userManager.getTeamNamesForRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModel(TeamModel model) {
      return userManager.updateTeamModel(model);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModels(Collection<TeamModel> models) {
      return userManager.updateTeamModels(models);
   }
   @Override
   public boolean updateTeamModel(String teamname, TeamModel model) {
      return userManager.updateTeamModel(teamname, model);
   }
   @Override
   public boolean deleteTeamModel(TeamModel model) {
      return userManager.deleteTeamModel(model);
   }
   @Override
   public List<String> getUsernamesForRepositoryRole(String role) {
      return userManager.getUsernamesForRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public boolean renameRepositoryRole(String oldRole, String newRole) {
      return userManager.renameRepositoryRole(oldRole, newRole);
   }
   @Override
   public boolean deleteRepositoryRole(String role) {
      return userManager.deleteRepositoryRole(role);
   }
   @Override
   public boolean deleteTeam(String teamname) {
      return userManager.deleteTeam(teamname);
   }
   /*
    * REPOSITORY MANAGER
    */
   @Override
   public Date getLastActivityDate() {
      return repositoryManager.getLastActivityDate();
   }
   @Override
   public File getRepositoriesFolder() {
      return repositoryManager.getRepositoriesFolder();
   }
   @Override
   public File getHooksFolder() {
      return repositoryManager.getHooksFolder();
   }
   @Override
   public File getGrapesFolder() {
      return repositoryManager.getGrapesFolder();
   }
   @Override
   public List<RegistrantAccessPermission> getUserAccessPermissions(UserModel user) {
      return repositoryManager.getUserAccessPermissions(user);
   }
   @Override
   public List<RegistrantAccessPermission> getUserAccessPermissions(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getUserAccessPermissions(repository);
   }
   @Override
   public boolean setUserAccessPermissions(RepositoryModel repository, Collection<RegistrantAccessPermission> permissions) {
      return repositoryManager.setUserAccessPermissions(repository, permissions);
   }
   @Override
   public List<String> getRepositoryUsers(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getRepositoryUsers(repository);
   }
   @Override
   public List<RegistrantAccessPermission> getTeamAccessPermissions(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getTeamAccessPermissions(repository);
   }
   @Override
   public boolean setTeamAccessPermissions(RepositoryModel repository, Collection<RegistrantAccessPermission> permissions) {
      return repositoryManager.setTeamAccessPermissions(repository, permissions);
   }
   @Override
   public List<String> getRepositoryTeams(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getRepositoryTeams(repository);
   }
   @Override
   public void addToCachedRepositoryList(RepositoryModel model) {
      repositoryManager.addToCachedRepositoryList(model);
   }
   @Override
   public void resetRepositoryListCache() {
      repositoryManager.resetRepositoryListCache();
   }
   @Override
   public List<String> getRepositoryList() {
      return repositoryManager.getRepositoryList();
   }
   @Override
   public Repository getRepository(String repositoryName) {
      return repositoryManager.getRepository(repositoryName);
   }
   @Override
   public Repository getRepository(String repositoryName, boolean logError) {
      return repositoryManager.getRepository(repositoryName, logError);
   }
   @Override
   public List<RepositoryModel> getRepositoryModels(UserModel user) {
      return repositoryManager.getRepositoryModels(user);
   }
   @Override
   public RepositoryModel getRepositoryModel(UserModel user, String repositoryName) {
      return repositoryManager.getRepositoryModel(repositoryName);
   }
   @Override
   public RepositoryModel getRepositoryModel(String repositoryName) {
      return repositoryManager.getRepositoryModel(repositoryName);
   }
   @Override
   public long getStarCount(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getStarCount(repository);
   }
   @Override
   public boolean hasRepository(String repositoryName) {
      return repositoryManager.hasRepository(repositoryName);
   }
   @Override
   public boolean hasRepository(String repositoryName, boolean caseSensitiveCheck) {
      return repositoryManager.hasRepository(repositoryName, caseSensitiveCheck);
   }
   @Override
   public boolean hasFork(String username, String origin) {
      return repositoryManager.hasFork(username, origin);
   }
   @Override
   public String getFork(String username, String origin) {
      return repositoryManager.getFork(username, origin);
   }
   @Override
   public ForkModel getForkNetwork(String repository) {
      return repositoryManager.getForkNetwork(repository);
   }
   @Override
   public long updateLastChangeFields(Repository r, RepositoryModel model) {
      return repositoryManager.updateLastChangeFields(r, model);
   }
   @Override
   public List<Metric> getRepositoryDefaultMetrics(RepositoryModel model, Repository repository) {
      return repositoryManager.getRepositoryDefaultMetrics(model, repository);
   }
   @Override
   public void updateRepositoryModel(String repositoryName, RepositoryModel repository,
         boolean isCreate) throws GitBlitException {
      repositoryManager.updateRepositoryModel(repositoryName, repository, isCreate);
   }
   @Override
   public void updateConfiguration(Repository r, RepositoryModel repository) {
      repositoryManager.updateConfiguration(r, repository);
   }
   @Override
   public boolean deleteRepositoryModel(RepositoryModel model) {
      return repositoryManager.deleteRepositoryModel(model);
   }
   @Override
   public boolean deleteRepository(String repositoryName) {
      return repositoryManager.deleteRepository(repositoryName);
   }
   @Override
   public List<String> getAllScripts() {
      return repositoryManager.getAllScripts();
   }
   @Override
   public List<String> getPreReceiveScriptsInherited(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getPreReceiveScriptsInherited(repository);
   }
   @Override
   public List<String> getPreReceiveScriptsUnused(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getPreReceiveScriptsUnused(repository);
   }
   @Override
   public List<String> getPostReceiveScriptsInherited(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getPostReceiveScriptsInherited(repository);
   }
   @Override
   public List<String> getPostReceiveScriptsUnused(RepositoryModel repository) {
      return repositoryManager.getPostReceiveScriptsUnused(repository);
   }
   @Override
   public List<SearchResult> search(String query, int page, int pageSize, List<String> repositories) {
      return repositoryManager.search(query, page, pageSize, repositories);
   }
   @Override
   public boolean isCollectingGarbage() {
      return repositoryManager.isCollectingGarbage();
   }
   @Override
   public boolean isCollectingGarbage(String repositoryName) {
      return repositoryManager.isCollectingGarbage(repositoryName);
   }
   /*
    * PROJECT MANAGER
    */
   @Override
   public List<ProjectModel> getProjectModels(UserModel user, boolean includeUsers) {
      return projectManager.getProjectModels(user, includeUsers);
   }
   @Override
   public ProjectModel getProjectModel(String name, UserModel user) {
      return projectManager.getProjectModel(name, user);
   }
   @Override
   public ProjectModel getProjectModel(String name) {
      return projectManager.getProjectModel(name);
   }
   @Override
   public List<ProjectModel> getProjectModels(List<RepositoryModel> repositoryModels, boolean includeUsers) {
      return projectManager.getProjectModels(repositoryModels, includeUsers);
   }
   /*
    * FEDERATION MANAGER
    */
   @Override
   public File getProposalsFolder() {
      return getManager(IRuntimeManager.class).getFileOrFolder(Keys.federation.proposalsFolder, "${baseFolder}/proposals");
   }
   /**
    * Returns a list of repository URLs and the user access permission.
    *
    * @param request
    * @param user
    * @param repository
    * @return a list of repository urls
    */
   @Override
   public List<RepositoryUrl> getRepositoryUrls(HttpServletRequest request, UserModel user, RepositoryModel repository) {
      if (user == null) {
         user = UserModel.ANONYMOUS;
      }
      String username = StringUtils.encodeUsername(UserModel.ANONYMOUS.equals(user) ? "" : user.username);
      List<RepositoryUrl> list = new ArrayList<RepositoryUrl>();
      // http/https url
      if (settings.getBoolean(Keys.git.enableGitServlet, true)) {
         AccessPermission permission = user.getRepositoryPermission(repository).permission;
         if (permission.exceeds(AccessPermission.NONE)) {
            list.add(new RepositoryUrl(getRepositoryUrl(request, username, repository), permission));
         }
      }
      // git daemon url
      String gitDaemonUrl = getGitDaemonUrl(request, user, repository);
      if (!StringUtils.isEmpty(gitDaemonUrl)) {
         AccessPermission permission = getGitDaemonAccessPermission(user, repository);
         if (permission.exceeds(AccessPermission.NONE)) {
            list.add(new RepositoryUrl(gitDaemonUrl, permission));
         }
      }
      // add all other urls
      // {0} = repository
      // {1} = username
      for (String url : settings.getStrings(Keys.web.otherUrls)) {
         if (url.contains("{1}")) {
            // external url requires username, only add url IF we have one
            if(!StringUtils.isEmpty(username)) {
               list.add(new RepositoryUrl(MessageFormat.format(url, repository.name, username), null));
            }
         } else {
            // external url does not require username
            list.add(new RepositoryUrl(MessageFormat.format(url, repository.name), null));
         }
      }
      return list;
   }
   protected String getRepositoryUrl(HttpServletRequest request, String username, RepositoryModel repository) {
      StringBuilder sb = new StringBuilder();
      sb.append(HttpUtils.getGitblitURL(request));
      sb.append(Constants.GIT_PATH);
      sb.append(repository.name);
      // inject username into repository url if authentication is required
      if (repository.accessRestriction.exceeds(AccessRestrictionType.NONE)
            && !StringUtils.isEmpty(username)) {
         sb.insert(sb.indexOf("://") + 3, username + "@");
      }
      return sb.toString();
   }
   protected String getGitDaemonUrl(HttpServletRequest request, UserModel user, RepositoryModel repository) {
      if (gitDaemon != null) {
         String bindInterface = settings.getString(Keys.git.daemonBindInterface, "localhost");
         if (bindInterface.equals("localhost")
               && (!request.getServerName().equals("localhost") && !request.getServerName().equals("127.0.0.1"))) {
            // git daemon is bound to localhost and the request is from elsewhere
            return null;
         }
         if (user.canClone(repository)) {
            String servername = request.getServerName();
            String url = gitDaemon.formatUrl(servername, repository.name);
            return url;
         }
      }
      return null;
   }
   protected AccessPermission getGitDaemonAccessPermission(UserModel user, RepositoryModel repository) {
      if (gitDaemon != null && user.canClone(repository)) {
         AccessPermission gitDaemonPermission = user.getRepositoryPermission(repository).permission;
         if (gitDaemonPermission.atLeast(AccessPermission.CLONE)) {
            if (repository.accessRestriction.atLeast(AccessRestrictionType.CLONE)) {
               // can not authenticate clone via anonymous git protocol
               gitDaemonPermission = AccessPermission.NONE;
            } else if (repository.accessRestriction.atLeast(AccessRestrictionType.PUSH)) {
               // can not authenticate push via anonymous git protocol
               gitDaemonPermission = AccessPermission.CLONE;
            } else {
               // normal user permission
            }
         }
         return gitDaemonPermission;
      }
      return AccessPermission.NONE;
   }
   /**
    * Returns the list of custom client applications to be used for the
    * repository url panel;
    *
    * @return a collection of client applications
    */
   @Override
   public Collection<GitClientApplication> getClientApplications() {
      // prefer user definitions, if they exist
      File userDefs = new File(getManager(IRuntimeManager.class).getBaseFolder(), "clientapps.json");
      if (userDefs.exists()) {
         Date lastModified = new Date(userDefs.lastModified());
         if (clientApplications.hasCurrent("user", lastModified)) {
            return clientApplications.getObject("user");
         } else {
            // (re)load user definitions
            try {
               InputStream is = new FileInputStream(userDefs);
               Collection<GitClientApplication> clients = readClientApplications(is);
               is.close();
               if (clients != null) {
                  clientApplications.updateObject("user", lastModified, clients);
                  return clients;
               }
            } catch (IOException e) {
               logger.error("Failed to deserialize " + userDefs.getAbsolutePath(), e);
            }
         }
      }
      // no user definitions, use system definitions
      if (!clientApplications.hasCurrent("system", new Date(0))) {
         try {
            InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/clientapps.json");
            Collection<GitClientApplication> clients = readClientApplications(is);
            is.close();
            if (clients != null) {
               clientApplications.updateObject("system", new Date(0), clients);
            }
         } catch (IOException e) {
            logger.error("Failed to deserialize clientapps.json resource!", e);
         }
      }
      return clientApplications.getObject("system");
   }
   private Collection<GitClientApplication> readClientApplications(InputStream is) {
      try {
         Type type = new TypeToken<Collection<GitClientApplication>>() {
         }.getType();
         InputStreamReader reader = new InputStreamReader(is);
         Gson gson = JsonUtils.gson();
         Collection<GitClientApplication> links = gson.fromJson(reader, type);
         return links;
      } catch (JsonIOException e) {
         logger.error("Error deserializing client applications!", e);
      } catch (JsonSyntaxException e) {
         logger.error("Error deserializing client applications!", e);
      }
      return null;
   }
   /**
    * Open a file resource using the Servlet container.
    * @param file to open
    * @return InputStream of the opened file
    * @throws ResourceStreamNotFoundException
    */
   public InputStream getResourceAsStream(String file) throws ResourceStreamNotFoundException {
      ContextRelativeResource res = WicketUtils.getResource(file);
      return res.getResourceStream().getInputStream();
      return federationManager.getProposalsFolder();
   }
   @Override
   public UserModel getFederationUser() {
      // the federation user is an administrator
      UserModel federationUser = new UserModel(Constants.FEDERATION_USER);
      federationUser.canAdmin = true;
      return federationUser;
   }
   /**
    * Adds/updates a complete user object keyed by username. This method allows
    * for renaming a user.
    *
    * @see IUserService.updateUserModel(String, UserModel)
    * @param username
    * @param user
    * @param isCreate
    * @throws GitBlitException
    */
   @Override
   public void updateUserModel(String username, UserModel user, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      if (!username.equalsIgnoreCase(user.username)) {
         if (getManager(IUserManager.class).getUserModel(user.username) != null) {
            throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                  "Failed to rename ''{0}'' because ''{1}'' already exists.", username,
                  user.username));
         }
         // rename repositories and owner fields for all repositories
         for (RepositoryModel model : getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoryModels(user)) {
            if (model.isUsersPersonalRepository(username)) {
               // personal repository
               model.addOwner(user.username);
               String oldRepositoryName = model.name;
               model.name = user.getPersonalPath() + model.name.substring(model.projectPath.length());
               model.projectPath = user.getPersonalPath();
               getManager(IRepositoryManager.class).updateRepositoryModel(oldRepositoryName, model, false);
            } else if (model.isOwner(username)) {
               // common/shared repo
               model.addOwner(user.username);
               getManager(IRepositoryManager.class).updateRepositoryModel(model.name, model, false);
            }
         }
      }
      if (!getManager(IUserManager.class).updateUserModel(username, user)) {
         throw new GitBlitException(isCreate ? "Failed to add user!" : "Failed to update user!");
      }
   }
   /**
    * Updates the TeamModel object for the specified name.
    *
    * @param teamname
    * @param team
    * @param isCreate
    */
   @Override
   public void updateTeamModel(String teamname, TeamModel team, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      if (!teamname.equalsIgnoreCase(team.name)) {
         if (getManager(IUserManager.class).getTeamModel(team.name) != null) {
            throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                  "Failed to rename ''{0}'' because ''{1}'' already exists.", teamname,
                  team.name));
         }
      }
      if (!getManager(IUserManager.class).updateTeamModel(teamname, team)) {
         throw new GitBlitException(isCreate ? "Failed to add team!" : "Failed to update team!");
      }
   }
   /**
    * Returns Gitblit's scheduled executor service for scheduling tasks.
    *
    * @return scheduledExecutor
    */
   public ScheduledExecutorService executor() {
      return scheduledExecutor;
      return federationManager.getFederationUser();
   }
   @Override
   public boolean canFederate() {
      String passphrase = settings.getString(Keys.federation.passphrase, "");
      return !StringUtils.isEmpty(passphrase);
      return federationManager.canFederate();
   }
   /**
    * Configures this Gitblit instance to pull any registered federated gitblit
    * instances.
    */
   private void configureFederation() {
      boolean validPassphrase = true;
      String passphrase = settings.getString(Keys.federation.passphrase, "");
      if (StringUtils.isEmpty(passphrase)) {
         logger.warn("Federation passphrase is blank! This server can not be PULLED from.");
         validPassphrase = false;
      }
      if (validPassphrase) {
         // standard tokens
         for (FederationToken tokenType : FederationToken.values()) {
            logger.info(MessageFormat.format("Federation {0} token = {1}", tokenType.name(),
                  getFederationToken(tokenType)));
         }
         // federation set tokens
         for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
            logger.info(MessageFormat.format("Federation Set {0} token = {1}", set,
                  getFederationToken(set)));
         }
      }
      // Schedule the federation executor
      List<FederationModel> registrations = getFederationRegistrations();
      if (registrations.size() > 0) {
         FederationPullExecutor executor = new FederationPullExecutor(registrations, true);
         scheduledExecutor.schedule(executor, 1, TimeUnit.MINUTES);
      }
   }
   /**
    * Returns the list of federated gitblit instances that this instance will
    * try to pull.
    *
    * @return list of registered gitblit instances
    */
   @Override
   public List<FederationModel> getFederationRegistrations() {
      if (federationRegistrations.isEmpty()) {
         federationRegistrations.addAll(FederationUtils.getFederationRegistrations(settings));
      }
      return federationRegistrations;
      return federationManager.getFederationRegistrations();
   }
   /**
    * Retrieve the specified federation registration.
    *
    * @param name
    *            the name of the registration
    * @return a federation registration
    */
   @Override
   public FederationModel getFederationRegistration(String url, String name) {
      // check registrations
      for (FederationModel r : getFederationRegistrations()) {
         if (r.name.equals(name) && r.url.equals(url)) {
            return r;
         }
      }
      // check the results
      for (FederationModel r : getFederationResultRegistrations()) {
         if (r.name.equals(name) && r.url.equals(url)) {
            return r;
         }
      }
      return null;
      return federationManager.getFederationRegistration(url, name);
   }
   /**
    * Returns the list of federation sets.
    *
    * @return list of federation sets
    */
   @Override
   public List<FederationSet> getFederationSets(String gitblitUrl) {
      List<FederationSet> list = new ArrayList<FederationSet>();
      // generate standard tokens
      for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
         FederationSet fset = new FederationSet(type.toString(), type, getFederationToken(type));
         fset.repositories = getRepositories(gitblitUrl, fset.token);
         list.add(fset);
      }
      // generate tokens for federation sets
      for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
         FederationSet fset = new FederationSet(set, FederationToken.REPOSITORIES,
               getFederationToken(set));
         fset.repositories = getRepositories(gitblitUrl, fset.token);
         list.add(fset);
      }
      return list;
      return federationManager.getFederationSets(gitblitUrl);
   }
   /**
    * Returns the list of possible federation tokens for this Gitblit instance.
    *
    * @return list of federation tokens
    */
   @Override
   public List<String> getFederationTokens() {
      List<String> tokens = new ArrayList<String>();
      // generate standard tokens
      for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
         tokens.add(getFederationToken(type));
      }
      // generate tokens for federation sets
      for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
         tokens.add(getFederationToken(set));
      }
      return tokens;
      return federationManager.getFederationTokens();
   }
   /**
    * Returns the specified federation token for this Gitblit instance.
    *
    * @param type
    * @return a federation token
    */
   @Override
   public String getFederationToken(FederationToken type) {
      return getFederationToken(type.name());
      return federationManager.getFederationToken(type);
   }
   /**
    * Returns the specified federation token for this Gitblit instance.
    *
    * @param value
    * @return a federation token
    */
   @Override
   public String getFederationToken(String value) {
      String passphrase = settings.getString(Keys.federation.passphrase, "");
      return StringUtils.getSHA1(passphrase + "-" + value);
      return federationManager.getFederationToken(value);
   }
   /**
    * Compares the provided token with this Gitblit instance's tokens and
    * determines if the requested permission may be granted to the token.
    *
    * @param req
    * @param token
    * @return true if the request can be executed
    */
   @Override
   public boolean validateFederationRequest(FederationRequest req, String token) {
      String all = getFederationToken(FederationToken.ALL);
      String unr = getFederationToken(FederationToken.USERS_AND_REPOSITORIES);
      String jur = getFederationToken(FederationToken.REPOSITORIES);
      switch (req) {
      case PULL_REPOSITORIES:
         return token.equals(all) || token.equals(unr) || token.equals(jur);
      case PULL_USERS:
      case PULL_TEAMS:
         return token.equals(all) || token.equals(unr);
      case PULL_SETTINGS:
      case PULL_SCRIPTS:
         return token.equals(all);
      default:
         break;
      }
      return false;
      return federationManager.validateFederationRequest(req, token);
   }
   /**
    * Acknowledge and cache the status of a remote Gitblit instance.
    *
    * @param identification
    *            the identification of the pulling Gitblit instance
    * @param registration
    *            the registration from the pulling Gitblit instance
    * @return true if acknowledged
    */
   @Override
   public boolean acknowledgeFederationStatus(String identification, FederationModel registration) {
      // reset the url to the identification of the pulling Gitblit instance
      registration.url = identification;
      String id = identification;
      if (!StringUtils.isEmpty(registration.folder)) {
         id += "-" + registration.folder;
      }
      federationPullResults.put(id, registration);
      return true;
      return federationManager.acknowledgeFederationStatus(identification, registration);
   }
   /**
    * Returns the list of registration results.
    *
    * @return the list of registration results
    */
   @Override
   public List<FederationModel> getFederationResultRegistrations() {
      return new ArrayList<FederationModel>(federationPullResults.values());
      return federationManager.getFederationResultRegistrations();
   }
   /**
    * Submit a federation proposal. The proposal is cached locally and the
    * Gitblit administrator(s) are notified via email.
    *
    * @param proposal
    *            the proposal
    * @param gitblitUrl
    *            the url of your gitblit instance to send an email to
    *            administrators
    * @return true if the proposal was submitted
    */
   @Override
   public boolean submitFederationProposal(FederationProposal proposal, String gitblitUrl) {
      // convert proposal to json
      String json = JsonUtils.toJsonString(proposal);
      try {
         // make the proposals folder
         File proposalsFolder = getProposalsFolder();
         proposalsFolder.mkdirs();
         // cache json to a file
         File file = new File(proposalsFolder, proposal.token + Constants.PROPOSAL_EXT);
         com.gitblit.utils.FileUtils.writeContent(file, json);
      } catch (Exception e) {
         logger.error(MessageFormat.format("Failed to cache proposal from {0}", proposal.url), e);
      }
      // send an email, if possible
      getManager(INotificationManager.class).sendMailToAdministrators("Federation proposal from " + proposal.url,
            "Please review the proposal @ " + gitblitUrl + "/proposal/" + proposal.token);
      return true;
      return federationManager.submitFederationProposal(proposal, gitblitUrl);
   }
   /**
    * Returns the list of pending federation proposals
    *
    * @return list of federation proposals
    */
   @Override
   public List<FederationProposal> getPendingFederationProposals() {
      List<FederationProposal> list = new ArrayList<FederationProposal>();
      File folder = getProposalsFolder();
      if (folder.exists()) {
         File[] files = folder.listFiles(new FileFilter() {
            @Override
            public boolean accept(File file) {
               return file.isFile()
                     && file.getName().toLowerCase().endsWith(Constants.PROPOSAL_EXT);
            }
         });
         for (File file : files) {
            String json = com.gitblit.utils.FileUtils.readContent(file, null);
            FederationProposal proposal = JsonUtils.fromJsonString(json,
                  FederationProposal.class);
            list.add(proposal);
         }
      }
      return list;
      return federationManager.getPendingFederationProposals();
   }
   /**
    * Get repositories for the specified token.
    *
    * @param gitblitUrl
    *            the base url of this gitblit instance
    * @param token
    *            the federation token
    * @return a map of <cloneurl, RepositoryModel>
    */
   @Override
   public Map<String, RepositoryModel> getRepositories(String gitblitUrl, String token) {
      Map<String, String> federationSets = new HashMap<String, String>();
      for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
         federationSets.put(getFederationToken(set), set);
      }
      // Determine the Gitblit clone url
      StringBuilder sb = new StringBuilder();
      sb.append(gitblitUrl);
      sb.append(Constants.GIT_PATH);
      sb.append("{0}");
      String cloneUrl = sb.toString();
      // Retrieve all available repositories
      UserModel user = getFederationUser();
      List<RepositoryModel> list = getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoryModels(user);
      // create the [cloneurl, repositoryModel] map
      Map<String, RepositoryModel> repositories = new HashMap<String, RepositoryModel>();
      for (RepositoryModel model : list) {
         // by default, setup the url for THIS repository
         String url = MessageFormat.format(cloneUrl, model.name);
         switch (model.federationStrategy) {
         case EXCLUDE:
            // skip this repository
            continue;
         case FEDERATE_ORIGIN:
            // federate the origin, if it is defined
            if (!StringUtils.isEmpty(model.origin)) {
               url = model.origin;
            }
            break;
         default:
            break;
         }
         if (federationSets.containsKey(token)) {
            // include repositories only for federation set
            String set = federationSets.get(token);
            if (model.federationSets.contains(set)) {
               repositories.put(url, model);
            }
         } else {
            // standard federation token for ALL
            repositories.put(url, model);
         }
      }
      return repositories;
      return federationManager.getRepositories(gitblitUrl, token);
   }
   /**
    * Creates a proposal from the token.
    *
    * @param gitblitUrl
    *            the url of this Gitblit instance
    * @param token
    * @return a potential proposal
    */
   @Override
   public FederationProposal createFederationProposal(String gitblitUrl, String token) {
      FederationToken tokenType = FederationToken.REPOSITORIES;
      for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
         if (token.equals(getFederationToken(type))) {
            tokenType = type;
            break;
         }
      }
      Map<String, RepositoryModel> repositories = getRepositories(gitblitUrl, token);
      FederationProposal proposal = new FederationProposal(gitblitUrl, tokenType, token,
            repositories);
      return proposal;
      return federationManager.createFederationProposal(gitblitUrl, token);
   }
   /**
    * Returns the proposal identified by the supplied token.
    *
    * @param token
    * @return the specified proposal or null
    */
   @Override
   public FederationProposal getPendingFederationProposal(String token) {
      List<FederationProposal> list = getPendingFederationProposals();
      for (FederationProposal proposal : list) {
         if (proposal.token.equals(token)) {
            return proposal;
         }
      }
      return null;
      return federationManager.getPendingFederationProposal(token);
   }
   /**
    * Deletes a pending federation proposal.
    *
    * @param a
    *            proposal
    * @return true if the proposal was deleted
    */
   @Override
   public boolean deletePendingFederationProposal(FederationProposal proposal) {
      File folder = getProposalsFolder();
      File file = new File(folder, proposal.token + Constants.PROPOSAL_EXT);
      return file.delete();
      return federationManager.deletePendingFederationProposal(proposal);
   }
   /**
    * Parse the properties file and aggregate all the comments by the setting
    * key. A setting model tracks the current value, the default value, the
    * description of the setting and and directives about the setting.
    *
    * @return Map<String, SettingModel>
   /*
    * GITBLIT MANAGER
    */
   private ServerSettings loadSettingModels(ServerSettings settingsModel) {
      // this entire "supports" concept will go away with user service refactoring
      UserModel externalUser = new UserModel(Constants.EXTERNAL_ACCOUNT);
      externalUser.password = Constants.EXTERNAL_ACCOUNT;
      IUserManager userManager = getManager(IUserManager.class);
      settingsModel.supportsCredentialChanges = userManager.supportsCredentialChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsDisplayNameChanges = userManager.supportsDisplayNameChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsEmailAddressChanges = userManager.supportsEmailAddressChanges(externalUser);
      settingsModel.supportsTeamMembershipChanges = userManager.supportsTeamMembershipChanges(externalUser);
      try {
         // Read bundled Gitblit properties to extract setting descriptions.
         // This copy is pristine and only used for populating the setting
         // models map.
         InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/reference.properties");
         BufferedReader propertiesReader = new BufferedReader(new InputStreamReader(is));
         StringBuilder description = new StringBuilder();
         SettingModel setting = new SettingModel();
         String line = null;
         while ((line = propertiesReader.readLine()) != null) {
            if (line.length() == 0) {
               description.setLength(0);
               setting = new SettingModel();
            } else {
               if (line.charAt(0) == '#') {
                  if (line.length() > 1) {
                     String text = line.substring(1).trim();
                     if (SettingModel.CASE_SENSITIVE.equals(text)) {
                        setting.caseSensitive = true;
                     } else if (SettingModel.RESTART_REQUIRED.equals(text)) {
                        setting.restartRequired = true;
                     } else if (SettingModel.SPACE_DELIMITED.equals(text)) {
                        setting.spaceDelimited = true;
                     } else if (text.startsWith(SettingModel.SINCE)) {
                        try {
                           setting.since = text.split(" ")[1];
                        } catch (Exception e) {
                           setting.since = text;
                        }
                     } else {
                        description.append(text);
                        description.append('\n');
                     }
                  }
               } else {
                  String[] kvp = line.split("=", 2);
                  String key = kvp[0].trim();
                  setting.name = key;
                  setting.defaultValue = kvp[1].trim();
                  setting.currentValue = setting.defaultValue;
                  setting.description = description.toString().trim();
                  settingsModel.add(setting);
                  description.setLength(0);
                  setting = new SettingModel();
               }
            }
         }
         propertiesReader.close();
      } catch (NullPointerException e) {
         logger.error("Failed to find resource copy of gitblit.properties");
      } catch (IOException e) {
         logger.error("Failed to load resource copy of gitblit.properties");
      }
      return settingsModel;
   }
   protected void configureFanout() {
      // startup Fanout PubSub service
      if (settings.getInteger(Keys.fanout.port, 0) > 0) {
         String bindInterface = settings.getString(Keys.fanout.bindInterface, null);
         int port = settings.getInteger(Keys.fanout.port, FanoutService.DEFAULT_PORT);
         boolean useNio = settings.getBoolean(Keys.fanout.useNio, true);
         int limit = settings.getInteger(Keys.fanout.connectionLimit, 0);
         if (useNio) {
            if (StringUtils.isEmpty(bindInterface)) {
               fanoutService = new FanoutNioService(port);
            } else {
               fanoutService = new FanoutNioService(bindInterface, port);
            }
         } else {
            if (StringUtils.isEmpty(bindInterface)) {
               fanoutService = new FanoutSocketService(port);
            } else {
               fanoutService = new FanoutSocketService(bindInterface, port);
            }
         }
         fanoutService.setConcurrentConnectionLimit(limit);
         fanoutService.setAllowAllChannelAnnouncements(false);
         fanoutService.start();
      }
   }
   protected void configureGitDaemon() {
      int port = settings.getInteger(Keys.git.daemonPort, 0);
      String bindInterface = settings.getString(Keys.git.daemonBindInterface, "localhost");
      if (port > 0) {
         try {
            // HACK temporary pending manager separation and injection
            Gitblit gitblit = new Gitblit(
                  getManager(IRuntimeManager.class),
                  getManager(INotificationManager.class),
                  getManager(IUserManager.class),
                  getManager(ISessionManager.class),
                  getManager(IRepositoryManager.class),
                  getManager(IProjectManager.class),
                  this,
                  this);
            gitDaemon = new GitDaemon(gitblit);
            gitDaemon.start();
         } catch (IOException e) {
            gitDaemon = null;
            logger.error(MessageFormat.format("Failed to start Git daemon on {0}:{1,number,0}", bindInterface, port), e);
         }
      }
   }
   protected final Logger getLogger() {
      return logger;
   }
   protected final ScheduledExecutorService getScheduledExecutor() {
      return scheduledExecutor;
   }
   /**
    * Configure Gitblit from the web.xml, if no configuration has already been
    * specified.
    *
    * @see ServletContextListener.contextInitialize(ServletContextEvent)
    */
   @Override
   protected void beforeServletInjection(ServletContext context) {
      ObjectGraph injector = getInjector(context);
      // create the runtime settings object
      IStoredSettings runtimeSettings = injector.get(IStoredSettings.class);
      this.settings = runtimeSettings; // XXX remove me eventually
      final File baseFolder;
      if (goSettings != null) {
         // Gitblit GO
         logger.debug("configuring Gitblit GO");
         baseFolder = configureGO(context, goSettings, goBaseFolder, runtimeSettings);
      } else {
         // servlet container
         WebXmlSettings webxmlSettings = new WebXmlSettings(context);
         String contextRealPath = context.getRealPath("/");
         File contextFolder = (contextRealPath != null) ? new File(contextRealPath) : null;
         if (!StringUtils.isEmpty(System.getenv("OPENSHIFT_DATA_DIR"))) {
            // RedHat OpenShift
            logger.debug("configuring Gitblit Express");
            baseFolder = configureExpress(context, webxmlSettings, contextFolder, runtimeSettings);
         } else {
            // standard WAR
            logger.debug("configuring Gitblit WAR");
            baseFolder = configureWAR(context, webxmlSettings, contextFolder, runtimeSettings);
         }
         // Test for Tomcat forward-slash/%2F issue and auto-adjust settings
         ContainerUtils.CVE_2007_0450.test(runtimeSettings);
      }
      // Runtime manager is a container for settings and other parameters
      IRuntimeManager runtime = startManager(injector, IRuntimeManager.class);
      runtime.setBaseFolder(baseFolder);
      runtime.getStatus().isGO = goSettings != null;
      runtime.getStatus().servletContainer = context.getServerInfo();
      startManager(injector, INotificationManager.class);
      startManager(injector, IUserManager.class);
      startManager(injector, ISessionManager.class);
      startManager(injector, IRepositoryManager.class);
      startManager(injector, IProjectManager.class);
      logger.info("Gitblit base folder     = " + baseFolder.getAbsolutePath());
      loadSettingModels(runtime.getSettingsModel());
      if (true/*startFederation*/) {
         configureFederation();
      }
      configureFanout();
      configureGitDaemon();
   }
   /**
    * Configures Gitblit GO
    *
    * @param context
    * @param settings
    * @param baseFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   protected File configureGO(
         ServletContext context,
         IStoredSettings goSettings,
         File goBaseFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(goSettings);
      File base = goBaseFolder;
      return base;
   }
   /**
    * Configures a standard WAR instance of Gitblit.
    *
    * @param context
    * @param webxmlSettings
    * @param contextFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   protected File configureWAR(
         ServletContext context,
         WebXmlSettings webxmlSettings,
         File contextFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // Gitblit is running in a standard servlet container
      logger.info("WAR contextFolder is " + ((contextFolder != null) ? contextFolder.getAbsolutePath() : "<empty>"));
      String path = webxmlSettings.getString(Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$ + "/WEB-INF/data");
      if (path.contains(Constants.contextFolder$) && contextFolder == null) {
         // warn about null contextFolder (issue-199)
         logger.error("");
         logger.error(MessageFormat.format("\"{0}\" depends on \"{1}\" but \"{2}\" is returning NULL for \"{1}\"!",
               Constants.baseFolder, Constants.contextFolder$, context.getServerInfo()));
         logger.error(MessageFormat.format("Please specify a non-parameterized path for <context-param> {0} in web.xml!!", Constants.baseFolder));
         logger.error(MessageFormat.format("OR configure your servlet container to specify a \"{0}\" parameter in the context configuration!!", Constants.baseFolder));
         logger.error("");
      }
      try {
         // try to lookup JNDI env-entry for the baseFolder
         InitialContext ic = new InitialContext();
         Context env = (Context) ic.lookup("java:comp/env");
         String val = (String) env.lookup("baseFolder");
         if (!StringUtils.isEmpty(val)) {
            path = val;
         }
      } catch (NamingException n) {
         logger.error("Failed to get JNDI env-entry: " + n.getExplanation());
      }
      File base = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.contextFolder$, contextFolder, path);
      base.mkdirs();
      // try to extract the data folder resource to the baseFolder
      File localSettings = new File(base, "gitblit.properties");
      if (!localSettings.exists()) {
         extractResources(context, "/WEB-INF/data/", base);
      }
      // delegate all config to baseFolder/gitblit.properties file
      FileSettings fileSettings = new FileSettings(localSettings.getAbsolutePath());
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(fileSettings);
      return base;
   }
   /**
    * Configures an OpenShift instance of Gitblit.
    *
    * @param context
    * @param webxmlSettings
    * @param contextFolder
    * @param runtimeSettings
    * @return the base folder
    */
   private File configureExpress(
         ServletContext context,
         WebXmlSettings webxmlSettings,
         File contextFolder,
         IStoredSettings runtimeSettings) {
      // Gitblit is running in OpenShift/JBoss
      String openShift = System.getenv("OPENSHIFT_DATA_DIR");
      File base = new File(openShift);
      logger.info("EXPRESS contextFolder is " + contextFolder.getAbsolutePath());
      // Copy the included scripts to the configured groovy folder
      String path = webxmlSettings.getString(Keys.groovy.scriptsFolder, "groovy");
      File localScripts = com.gitblit.utils.FileUtils.resolveParameter(Constants.baseFolder$, base, path);
      if (!localScripts.exists()) {
         File warScripts = new File(contextFolder, "/WEB-INF/data/groovy");
         if (!warScripts.equals(localScripts)) {
            try {
               com.gitblit.utils.FileUtils.copy(localScripts, warScripts.listFiles());
            } catch (IOException e) {
               logger.error(MessageFormat.format(
                     "Failed to copy included Groovy scripts from {0} to {1}",
                     warScripts, localScripts));
            }
         }
      }
      // merge the WebXmlSettings into the runtime settings (for backwards-compatibilty)
      runtimeSettings.merge(webxmlSettings);
      // settings are to be stored in openshift/gitblit.properties
      File localSettings = new File(base, "gitblit.properties");
      FileSettings fileSettings = new FileSettings(localSettings.getAbsolutePath());
      // merge the stored settings into the runtime settings
      //
      // if runtimeSettings is also a FileSettings w/o a specified target file,
      // the target file for runtimeSettings is set to "localSettings".
      runtimeSettings.merge(fileSettings);
      return base;
   }
   protected void extractResources(ServletContext context, String path, File toDir) {
      for (String resource : context.getResourcePaths(path)) {
         // extract the resource to the directory if it does not exist
         File f = new File(toDir, resource.substring(path.length()));
         if (!f.exists()) {
            InputStream is = null;
            OutputStream os = null;
            try {
               if (resource.charAt(resource.length() - 1) == '/') {
                  // directory
                  f.mkdirs();
                  extractResources(context, resource, f);
               } else {
                  // file
                  f.getParentFile().mkdirs();
                  is = context.getResourceAsStream(resource);
                  os = new FileOutputStream(f);
                  byte [] buffer = new byte[4096];
                  int len = 0;
                  while ((len = is.read(buffer)) > -1) {
                     os.write(buffer, 0, len);
                  }
               }
            } catch (FileNotFoundException e) {
               logger.error("Failed to find resource \"" + resource + "\"", e);
            } catch (IOException e) {
               logger.error("Failed to copy resource \"" + resource + "\" to " + f, e);
            } finally {
               if (is != null) {
                  try {
                     is.close();
                  } catch (IOException e) {
                     // ignore
                  }
               }
               if (os != null) {
                  try {
                     os.close();
                  } catch (IOException e) {
                     // ignore
                  }
               }
            }
         }
      }
   }
   /**
    * Gitblit is being shutdown either because the servlet container is
    * shutting down or because the servlet container is re-deploying Gitblit.
    */
   @Override
   protected void destroyContext(ServletContext context) {
      logger.info("Gitblit context destroyed by servlet container.");
      for (IManager manager : managers) {
         logger.debug("stopping {}", manager.getClass().getSimpleName());
         manager.stop();
      }
      scheduledExecutor.shutdownNow();
      if (fanoutService != null) {
         fanoutService.stop();
      }
      if (gitDaemon != null) {
         gitDaemon.stop();
      }
   }
   /**
    * Creates a personal fork of the specified repository. The clone is view
    * restricted by default and the owner of the source repository is given
    * access to the clone.
    *
    * @param repository
    * @param user
    * @return the repository model of the fork, if successful
    * @throws GitBlitException
    */
   @Override
   public RepositoryModel fork(RepositoryModel repository, UserModel user) throws GitBlitException {
      String cloneName = MessageFormat.format("{0}/{1}.git", user.getPersonalPath(), StringUtils.stripDotGit(StringUtils.getLastPathElement(repository.name)));
      String fromUrl = MessageFormat.format("file://{0}/{1}", getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoriesFolder().getAbsolutePath(), repository.name);
      // clone the repository
      try {
         JGitUtils.cloneRepository(getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoriesFolder(), cloneName, fromUrl, true, null);
      } catch (Exception e) {
         throw new GitBlitException(e);
      }
      // create a Gitblit repository model for the clone
      RepositoryModel cloneModel = repository.cloneAs(cloneName);
      // owner has REWIND/RW+ permissions
      cloneModel.addOwner(user.username);
      getManager(IRepositoryManager.class).updateRepositoryModel(cloneName, cloneModel, false);
      // add the owner of the source repository to the clone's access list
      if (!ArrayUtils.isEmpty(repository.owners)) {
         for (String owner : repository.owners) {
            UserModel originOwner = getManager(IUserManager.class).getUserModel(owner);
            if (originOwner != null) {
               originOwner.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
               updateUserModel(originOwner.username, originOwner, false);
            }
         }
      }
      // grant origin's user list clone permission to fork
      List<String> users = getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoryUsers(repository);
      List<UserModel> cloneUsers = new ArrayList<UserModel>();
      for (String name : users) {
         if (!name.equalsIgnoreCase(user.username)) {
            UserModel cloneUser = getManager(IUserManager.class).getUserModel(name);
            if (cloneUser.canClone(repository)) {
               // origin user can clone origin, grant clone access to fork
               cloneUser.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
            }
            cloneUsers.add(cloneUser);
         }
      }
      getManager(IUserManager.class).updateUserModels(cloneUsers);
      // grant origin's team list clone permission to fork
      List<String> teams = getManager(IRepositoryManager.class).getRepositoryTeams(repository);
      List<TeamModel> cloneTeams = new ArrayList<TeamModel>();
      for (String name : teams) {
         TeamModel cloneTeam = getManager(IUserManager.class).getTeamModel(name);
         if (cloneTeam.canClone(repository)) {
            // origin team can clone origin, grant clone access to fork
            cloneTeam.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
         }
         cloneTeams.add(cloneTeam);
      }
      getManager(IUserManager.class).updateTeamModels(cloneTeams);
      // add this clone to the cached model
      getManager(IRepositoryManager.class).addToCachedRepositoryList(cloneModel);
      return cloneModel;
      return gitblitManager.fork(repository, user);
   }
   @Override
   protected Object [] getModules() {
      return new Object [] { new DaggerModule(this) };
   public void updateTeamModel(String teamname, TeamModel team, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      gitblitManager.updateTeamModel(teamname, team, isCreate);
   }
   protected <X extends IManager> X startManager(ObjectGraph injector, Class<X> clazz) {
      logger.debug("injecting and starting {}", clazz.getSimpleName());
      X x = injector.get(clazz);
      x.setup();
      managers.add(x);
      return x;
   }
   /**
    * Instantiate and inject all filters and servlets into the container using
    * the servlet 3 specification.
    */
   @Override
   protected void injectServlets(ServletContext context) {
      // access restricted servlets
      serve(context, Constants.GIT_PATH, GitServlet.class, GitFilter.class);
      serve(context, Constants.PAGES, PagesServlet.class, PagesFilter.class);
      serve(context, Constants.RPC_PATH, RpcServlet.class, RpcFilter.class);
      serve(context, Constants.ZIP_PATH, DownloadZipServlet.class, DownloadZipFilter.class);
      serve(context, Constants.SYNDICATION_PATH, SyndicationServlet.class, SyndicationFilter.class);
   public void updateUserModel(String username, UserModel user, boolean isCreate)
         throws GitBlitException {
      gitblitManager.updateUserModel(username, user, isCreate);
   }
      // servlets
      serve(context, Constants.FEDERATION_PATH, FederationServlet.class);
      serve(context, Constants.SPARKLESHARE_INVITE_PATH, SparkleShareInviteServlet.class);
      serve(context, Constants.BRANCH_GRAPH_PATH, BranchGraphServlet.class);
      file(context, "/robots.txt", RobotsTxtServlet.class);
      file(context, "/logo.png", LogoServlet.class);
   @Override
   public List<RepositoryUrl> getRepositoryUrls(HttpServletRequest request, UserModel user, RepositoryModel repository) {
      return gitblitManager.getRepositoryUrls(request, user, repository);
   }
      // optional force basic authentication
      filter(context, "/*", EnforceAuthenticationFilter.class, null);
      // Wicket
      String toIgnore = StringUtils.flattenStrings(getRegisteredPaths(), ",");
      Map<String, String> params = new HashMap<String, String>();
      params.put(GitblitWicketFilter.FILTER_MAPPING_PARAM, "/*");
      params.put(GitblitWicketFilter.IGNORE_PATHS_PARAM, toIgnore);
      filter(context, "/*", GitblitWicketFilter.class, params);
   @Override
   public Collection<GitClientApplication> getClientApplications() {
      return gitblitManager.getClientApplications();
   }
}